Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lmod3E9QA62 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lmod3E9QA62 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lmod3E9QA62 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lmod3E9QA62 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lmod3E9QA62 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lmod3E9QA62 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lmod3E9QA62 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lmod3E9QA62 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lmod3E9QA62 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lmod3E9QA62 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lmod3E9QA62 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lmod3E9QA62 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lmod3E9QA62 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lmod3E9QA62 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lmod3E9QA62 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lmod3E9QA62 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lmod3E9QA62 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lmod3E9QA62 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lmod3E9QA62 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lmod3E9QA62 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lmod3E9QA62 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lmod3E9QA62 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lmod3E9QA62 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lmod3E9QA62 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lmod3E9QA62 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lmod3E9QA62 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lmod3E9QA62 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lmod3E9QA62 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lmod3E9QA62 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lmod3E9QA62 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lmod3E9QA62 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lmod3E9QA62 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lmod3E9QA62 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lmod3E9QA62 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lmod3E9QA62 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lmod3E9QA62 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lmod3E9QA62 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lmod3E9QA62 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lmod3E9QA62 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lmod3E9QA62 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lmod3E9QA62 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lmod3E9QA62 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lmod3E9QA62 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lmod3E9QA62 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lmod3E9QA62 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lmod3E9QA62 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lmod3E9QA62 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Lmod3E9QA62 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lmod3E9QA62 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lmod3E9QA62 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lmod3E9QA62 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lmod3E9QA62 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lmod3E9QA62 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lmod3E9QA62 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lmod3E9QA62 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lmod3E9QA62 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lmod3E9QA62 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lmod3E9QA62 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lmod3E9QA62 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lmod3E9QA62 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lmod3E9QA62 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lmod3E9QA62 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lmod3E9QA62 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lmod3E9QA62 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lmod3E9QA62 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lmod3E9QA62 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lmod3E9QA62 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lmod3E9QA62 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lmod3E9QA62 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lmod3E9QA62 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lmod3E9QA62 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lmod3E9QA62 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lmod3E9QA62 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lmod3E9QA62 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lmod3E9QA62 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lmod3E9QA62 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lmod3E9QA62 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lmod3E9QA62 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lmod3E9QA62 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lmod3E9QA62 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Lmod3E9QA62 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lmod3E9QA62 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lmod3E9QA62 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lmod3E9QA62 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lmod3E9QA62 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lmod3E9QA62 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lmod3E9QA62 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Lmod3E9QA62 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lmod3E9QA62 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lmod3E9QA62 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lmod3E9QA62 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lmod3E9QA62 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lmod3E9QA62 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lmod3E9QA62 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lmod3E9QA62 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Lmod3E9QA62 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lmod3E9QA62 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lmod3E9QA62 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lmod3E9QA62 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms