Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp17lbE9Q9U0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp17lbE9Q9U0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp17lbE9Q9U0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp17lbE9Q9U0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp17lbE9Q9U0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp17lbE9Q9U0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Usp17lbE9Q9U0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp17lbE9Q9U0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp17lbE9Q9U0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp17lbE9Q9U0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp17lbE9Q9U0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp17lbE9Q9U0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp17lbE9Q9U0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp17lbE9Q9U0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp17lbE9Q9U0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp17lbE9Q9U0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp17lbE9Q9U0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp17lbE9Q9U0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp17lbE9Q9U0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp17lbE9Q9U0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Usp17lbE9Q9U0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Usp17lbE9Q9U0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp17lbE9Q9U0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp17lbE9Q9U0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp17lbE9Q9U0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp17lbE9Q9U0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp17lbE9Q9U0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp17lbE9Q9U0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp17lbE9Q9U0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp17lbE9Q9U0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp17lbE9Q9U0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp17lbE9Q9U0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp17lbE9Q9U0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp17lbE9Q9U0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp17lbE9Q9U0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp17lbE9Q9U0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp17lbE9Q9U0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp17lbE9Q9U0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp17lbE9Q9U0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp17lbE9Q9U0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp17lbE9Q9U0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp17lbE9Q9U0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp17lbE9Q9U0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp17lbE9Q9U0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp17lbE9Q9U0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp17lbE9Q9U0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp17lbE9Q9U0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp17lbE9Q9U0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp17lbE9Q9U0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp17lbE9Q9U0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp17lbE9Q9U0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp17lbE9Q9U0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp17lbE9Q9U0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp17lbE9Q9U0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp17lbE9Q9U0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp17lbE9Q9U0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp17lbE9Q9U0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp17lbE9Q9U0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp17lbE9Q9U0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp17lbE9Q9U0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp17lbE9Q9U0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp17lbE9Q9U0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp17lbE9Q9U0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp17lbE9Q9U0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp17lbE9Q9U0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp17lbE9Q9U0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp17lbE9Q9U0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp17lbE9Q9U0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp17lbE9Q9U0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp17lbE9Q9U0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp17lbE9Q9U0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp17lbE9Q9U0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp17lbE9Q9U0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp17lbE9Q9U0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp17lbE9Q9U0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Usp17lbE9Q9U0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp17lbE9Q9U0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp17lbE9Q9U0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp17lbE9Q9U0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp17lbE9Q9U0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp17lbE9Q9U0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp17lbE9Q9U0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp17lbE9Q9U0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp17lbE9Q9U0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp17lbE9Q9U0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp17lbE9Q9U0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp17lbE9Q9U0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp17lbE9Q9U0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp17lbE9Q9U0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Usp17lbE9Q9U0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms