Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp17lbE9Q9U0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp17lbE9Q9U0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp17lbE9Q9U0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp17lbE9Q9U0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp17lbE9Q9U0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp17lbE9Q9U0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Usp17lbE9Q9U0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp17lbE9Q9U0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp17lbE9Q9U0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp17lbE9Q9U0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp17lbE9Q9U0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp17lbE9Q9U0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp17lbE9Q9U0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp17lbE9Q9U0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp17lbE9Q9U0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp17lbE9Q9U0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp17lbE9Q9U0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp17lbE9Q9U0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp17lbE9Q9U0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp17lbE9Q9U0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Usp17lbE9Q9U0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Usp17lbE9Q9U0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp17lbE9Q9U0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp17lbE9Q9U0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp17lbE9Q9U0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp17lbE9Q9U0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp17lbE9Q9U0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp17lbE9Q9U0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp17lbE9Q9U0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp17lbE9Q9U0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp17lbE9Q9U0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp17lbE9Q9U0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp17lbE9Q9U0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp17lbE9Q9U0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp17lbE9Q9U0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp17lbE9Q9U0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp17lbE9Q9U0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp17lbE9Q9U0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp17lbE9Q9U0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp17lbE9Q9U0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp17lbE9Q9U0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp17lbE9Q9U0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp17lbE9Q9U0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp17lbE9Q9U0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp17lbE9Q9U0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp17lbE9Q9U0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp17lbE9Q9U0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp17lbE9Q9U0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp17lbE9Q9U0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp17lbE9Q9U0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp17lbE9Q9U0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp17lbE9Q9U0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp17lbE9Q9U0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp17lbE9Q9U0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp17lbE9Q9U0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp17lbE9Q9U0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp17lbE9Q9U0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp17lbE9Q9U0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp17lbE9Q9U0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp17lbE9Q9U0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp17lbE9Q9U0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp17lbE9Q9U0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp17lbE9Q9U0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp17lbE9Q9U0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp17lbE9Q9U0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp17lbE9Q9U0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp17lbE9Q9U0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp17lbE9Q9U0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp17lbE9Q9U0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp17lbE9Q9U0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp17lbE9Q9U0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp17lbE9Q9U0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp17lbE9Q9U0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp17lbE9Q9U0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp17lbE9Q9U0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Usp17lbE9Q9U0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp17lbE9Q9U0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp17lbE9Q9U0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp17lbE9Q9U0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp17lbE9Q9U0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp17lbE9Q9U0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp17lbE9Q9U0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp17lbE9Q9U0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp17lbE9Q9U0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp17lbE9Q9U0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp17lbE9Q9U0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp17lbE9Q9U0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp17lbE9Q9U0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp17lbE9Q9U0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Usp17lbE9Q9U0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
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