Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp31E9Q6Y8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp31E9Q6Y8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp31E9Q6Y8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp31E9Q6Y8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp31E9Q6Y8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp31E9Q6Y8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp31E9Q6Y8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp31E9Q6Y8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp31E9Q6Y8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp31E9Q6Y8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp31E9Q6Y8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp31E9Q6Y8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp31E9Q6Y8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp31E9Q6Y8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Usp31E9Q6Y8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Usp31E9Q6Y8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp31E9Q6Y8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp31E9Q6Y8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp31E9Q6Y8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp31E9Q6Y8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp31E9Q6Y8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp31E9Q6Y8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp31E9Q6Y8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp31E9Q6Y8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp31E9Q6Y8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp31E9Q6Y8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp31E9Q6Y8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp31E9Q6Y8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp31E9Q6Y8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp31E9Q6Y8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp31E9Q6Y8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp31E9Q6Y8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp31E9Q6Y8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp31E9Q6Y8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp31E9Q6Y8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp31E9Q6Y8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp31E9Q6Y8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Usp31E9Q6Y8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp31E9Q6Y8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp31E9Q6Y8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp31E9Q6Y8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp31E9Q6Y8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp31E9Q6Y8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp31E9Q6Y8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp31E9Q6Y8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp31E9Q6Y8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp31E9Q6Y8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp31E9Q6Y8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp31E9Q6Y8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp31E9Q6Y8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp31E9Q6Y8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp31E9Q6Y8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp31E9Q6Y8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp31E9Q6Y8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp31E9Q6Y8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp31E9Q6Y8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp31E9Q6Y8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp31E9Q6Y8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp31E9Q6Y8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp31E9Q6Y8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp31E9Q6Y8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp31E9Q6Y8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp31E9Q6Y8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp31E9Q6Y8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp31E9Q6Y8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp31E9Q6Y8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp31E9Q6Y8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp31E9Q6Y8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp31E9Q6Y8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp31E9Q6Y8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp31E9Q6Y8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp31E9Q6Y8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp31E9Q6Y8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp31E9Q6Y8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp31E9Q6Y8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp31E9Q6Y8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp31E9Q6Y8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp31E9Q6Y8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp31E9Q6Y8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp31E9Q6Y8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp31E9Q6Y8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp31E9Q6Y8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp31E9Q6Y8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp31E9Q6Y8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp31E9Q6Y8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp31E9Q6Y8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp31E9Q6Y8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Usp31E9Q6Y8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Usp31E9Q6Y8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp31E9Q6Y8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp31E9Q6Y8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp31E9Q6Y8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp31E9Q6Y8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp31E9Q6Y8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp31E9Q6Y8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp31E9Q6Y8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp31E9Q6Y8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp31E9Q6Y8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp31E9Q6Y8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms