Protein–RNA interactions for Protein: E9Q501

Gm2237, Predicted gene 2237, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2237E9Q501 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2237E9Q501 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2237E9Q501 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2237E9Q501 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2237E9Q501 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2237E9Q501 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2237E9Q501 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm2237E9Q501 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm2237E9Q501 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2237E9Q501 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2237E9Q501 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2237E9Q501 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2237E9Q501 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2237E9Q501 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm2237E9Q501 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm2237E9Q501 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm2237E9Q501 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm2237E9Q501 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm2237E9Q501 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm2237E9Q501 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm2237E9Q501 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm2237E9Q501 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm2237E9Q501 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm2237E9Q501 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm2237E9Q501 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm2237E9Q501 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm2237E9Q501 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm2237E9Q501 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm2237E9Q501 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm2237E9Q501 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm2237E9Q501 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm2237E9Q501 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm2237E9Q501 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm2237E9Q501 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm2237E9Q501 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm2237E9Q501 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm2237E9Q501 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm2237E9Q501 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm2237E9Q501 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm2237E9Q501 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm2237E9Q501 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm2237E9Q501 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm2237E9Q501 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm2237E9Q501 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm2237E9Q501 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm2237E9Q501 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm2237E9Q501 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm2237E9Q501 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm2237E9Q501 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm2237E9Q501 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm2237E9Q501 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm2237E9Q501 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm2237E9Q501 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm2237E9Q501 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm2237E9Q501 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm2237E9Q501 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm2237E9Q501 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm2237E9Q501 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm2237E9Q501 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm2237E9Q501 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm2237E9Q501 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm2237E9Q501 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm2237E9Q501 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm2237E9Q501 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm2237E9Q501 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm2237E9Q501 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm2237E9Q501 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm2237E9Q501 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm2237E9Q501 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm2237E9Q501 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm2237E9Q501 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm2237E9Q501 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm2237E9Q501 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm2237E9Q501 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm2237E9Q501 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm2237E9Q501 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm2237E9Q501 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm2237E9Q501 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm2237E9Q501 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm2237E9Q501 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm2237E9Q501 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm2237E9Q501 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm2237E9Q501 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm2237E9Q501 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm2237E9Q501 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm2237E9Q501 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm2237E9Q501 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm2237E9Q501 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm2237E9Q501 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm2237E9Q501 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm2237E9Q501 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm2237E9Q501 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm2237E9Q501 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm2237E9Q501 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm2237E9Q501 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm2237E9Q501 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm2237E9Q501 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm2237E9Q501 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm2237E9Q501 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm2237E9Q501 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms