Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3M9

2010300C02Rik, RIKEN cDNA 2010300C02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2010300C02RikE9Q3M9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
2010300C02RikE9Q3M9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
2010300C02RikE9Q3M9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
2010300C02RikE9Q3M9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
2010300C02RikE9Q3M9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
2010300C02RikE9Q3M9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
2010300C02RikE9Q3M9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
2010300C02RikE9Q3M9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
2010300C02RikE9Q3M9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
2010300C02RikE9Q3M9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
2010300C02RikE9Q3M9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
2010300C02RikE9Q3M9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
2010300C02RikE9Q3M9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
2010300C02RikE9Q3M9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
2010300C02RikE9Q3M9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
2010300C02RikE9Q3M9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
2010300C02RikE9Q3M9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
2010300C02RikE9Q3M9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
2010300C02RikE9Q3M9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
2010300C02RikE9Q3M9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
2010300C02RikE9Q3M9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
2010300C02RikE9Q3M9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
2010300C02RikE9Q3M9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
2010300C02RikE9Q3M9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
2010300C02RikE9Q3M9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
2010300C02RikE9Q3M9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
2010300C02RikE9Q3M9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
2010300C02RikE9Q3M9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
2010300C02RikE9Q3M9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
2010300C02RikE9Q3M9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
2010300C02RikE9Q3M9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
2010300C02RikE9Q3M9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
2010300C02RikE9Q3M9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
2010300C02RikE9Q3M9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
2010300C02RikE9Q3M9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
2010300C02RikE9Q3M9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
2010300C02RikE9Q3M9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
2010300C02RikE9Q3M9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
2010300C02RikE9Q3M9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
2010300C02RikE9Q3M9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
2010300C02RikE9Q3M9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
2010300C02RikE9Q3M9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
2010300C02RikE9Q3M9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
2010300C02RikE9Q3M9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
2010300C02RikE9Q3M9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
2010300C02RikE9Q3M9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
2010300C02RikE9Q3M9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
2010300C02RikE9Q3M9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
2010300C02RikE9Q3M9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
2010300C02RikE9Q3M9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
2010300C02RikE9Q3M9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
2010300C02RikE9Q3M9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
2010300C02RikE9Q3M9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
2010300C02RikE9Q3M9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
2010300C02RikE9Q3M9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
2010300C02RikE9Q3M9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
2010300C02RikE9Q3M9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
2010300C02RikE9Q3M9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
2010300C02RikE9Q3M9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
2010300C02RikE9Q3M9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
2010300C02RikE9Q3M9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
2010300C02RikE9Q3M9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
2010300C02RikE9Q3M9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
2010300C02RikE9Q3M9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
2010300C02RikE9Q3M9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
2010300C02RikE9Q3M9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
2010300C02RikE9Q3M9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
2010300C02RikE9Q3M9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
2010300C02RikE9Q3M9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
2010300C02RikE9Q3M9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
2010300C02RikE9Q3M9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
2010300C02RikE9Q3M9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
2010300C02RikE9Q3M9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
2010300C02RikE9Q3M9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
2010300C02RikE9Q3M9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
2010300C02RikE9Q3M9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
2010300C02RikE9Q3M9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
2010300C02RikE9Q3M9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
2010300C02RikE9Q3M9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
2010300C02RikE9Q3M9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
2010300C02RikE9Q3M9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
2010300C02RikE9Q3M9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
2010300C02RikE9Q3M9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
2010300C02RikE9Q3M9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
2010300C02RikE9Q3M9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
2010300C02RikE9Q3M9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
2010300C02RikE9Q3M9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
2010300C02RikE9Q3M9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
2010300C02RikE9Q3M9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
2010300C02RikE9Q3M9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
2010300C02RikE9Q3M9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
2010300C02RikE9Q3M9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
2010300C02RikE9Q3M9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
2010300C02RikE9Q3M9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
2010300C02RikE9Q3M9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
2010300C02RikE9Q3M9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
2010300C02RikE9Q3M9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
2010300C02RikE9Q3M9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
2010300C02RikE9Q3M9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
2010300C02RikE9Q3M9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms