Protein–RNA interactions for Protein: E9Q346

Vmn1r160, Taste receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r160E9Q346 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r160E9Q346 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r160E9Q346 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r160E9Q346 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r160E9Q346 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r160E9Q346 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r160E9Q346 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r160E9Q346 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r160E9Q346 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r160E9Q346 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r160E9Q346 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r160E9Q346 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r160E9Q346 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r160E9Q346 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r160E9Q346 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r160E9Q346 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r160E9Q346 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r160E9Q346 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r160E9Q346 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r160E9Q346 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r160E9Q346 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r160E9Q346 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r160E9Q346 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r160E9Q346 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r160E9Q346 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r160E9Q346 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r160E9Q346 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r160E9Q346 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r160E9Q346 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r160E9Q346 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r160E9Q346 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r160E9Q346 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r160E9Q346 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r160E9Q346 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r160E9Q346 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r160E9Q346 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r160E9Q346 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r160E9Q346 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r160E9Q346 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r160E9Q346 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r160E9Q346 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r160E9Q346 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r160E9Q346 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r160E9Q346 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r160E9Q346 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r160E9Q346 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r160E9Q346 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r160E9Q346 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r160E9Q346 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r160E9Q346 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r160E9Q346 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r160E9Q346 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r160E9Q346 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r160E9Q346 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r160E9Q346 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r160E9Q346 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r160E9Q346 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r160E9Q346 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r160E9Q346 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r160E9Q346 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r160E9Q346 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r160E9Q346 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r160E9Q346 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r160E9Q346 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r160E9Q346 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r160E9Q346 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r160E9Q346 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r160E9Q346 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r160E9Q346 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r160E9Q346 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r160E9Q346 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r160E9Q346 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r160E9Q346 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r160E9Q346 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r160E9Q346 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r160E9Q346 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r160E9Q346 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r160E9Q346 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r160E9Q346 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r160E9Q346 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r160E9Q346 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r160E9Q346 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r160E9Q346 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r160E9Q346 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r160E9Q346 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r160E9Q346 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r160E9Q346 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r160E9Q346 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r160E9Q346 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r160E9Q346 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r160E9Q346 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r160E9Q346 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r160E9Q346 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r160E9Q346 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r160E9Q346 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r160E9Q346 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r160E9Q346 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r160E9Q346 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r160E9Q346 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r160E9Q346 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms