Protein–RNA interactions for Protein: E9Q101

Gm6034, Predicted gene 6034, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6034E9Q101 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm6034E9Q101 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm6034E9Q101 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm6034E9Q101 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm6034E9Q101 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm6034E9Q101 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm6034E9Q101 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm6034E9Q101 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm6034E9Q101 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm6034E9Q101 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm6034E9Q101 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm6034E9Q101 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm6034E9Q101 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm6034E9Q101 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm6034E9Q101 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm6034E9Q101 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm6034E9Q101 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm6034E9Q101 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm6034E9Q101 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm6034E9Q101 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm6034E9Q101 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm6034E9Q101 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm6034E9Q101 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm6034E9Q101 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm6034E9Q101 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm6034E9Q101 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm6034E9Q101 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm6034E9Q101 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm6034E9Q101 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm6034E9Q101 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm6034E9Q101 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm6034E9Q101 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm6034E9Q101 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm6034E9Q101 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm6034E9Q101 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm6034E9Q101 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm6034E9Q101 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm6034E9Q101 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm6034E9Q101 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm6034E9Q101 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm6034E9Q101 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm6034E9Q101 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm6034E9Q101 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm6034E9Q101 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm6034E9Q101 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm6034E9Q101 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm6034E9Q101 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm6034E9Q101 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm6034E9Q101 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm6034E9Q101 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm6034E9Q101 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm6034E9Q101 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm6034E9Q101 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm6034E9Q101 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm6034E9Q101 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm6034E9Q101 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm6034E9Q101 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm6034E9Q101 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm6034E9Q101 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm6034E9Q101 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm6034E9Q101 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm6034E9Q101 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm6034E9Q101 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm6034E9Q101 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm6034E9Q101 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm6034E9Q101 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm6034E9Q101 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm6034E9Q101 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm6034E9Q101 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm6034E9Q101 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm6034E9Q101 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm6034E9Q101 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm6034E9Q101 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm6034E9Q101 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm6034E9Q101 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm6034E9Q101 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm6034E9Q101 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm6034E9Q101 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm6034E9Q101 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm6034E9Q101 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm6034E9Q101 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm6034E9Q101 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm6034E9Q101 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm6034E9Q101 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm6034E9Q101 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm6034E9Q101 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm6034E9Q101 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm6034E9Q101 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm6034E9Q101 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm6034E9Q101 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm6034E9Q101 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm6034E9Q101 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm6034E9Q101 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm6034E9Q101 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm6034E9Q101 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm6034E9Q101 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm6034E9Q101 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm6034E9Q101 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm6034E9Q101 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm6034E9Q101 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.5 ms