Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gm20425E9Q035 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gm20425E9Q035 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gm20425E9Q035 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gm20425E9Q035 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm20425E9Q035 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm20425E9Q035 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm20425E9Q035 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm20425E9Q035 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm20425E9Q035 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm20425E9Q035 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm20425E9Q035 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm20425E9Q035 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm20425E9Q035 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm20425E9Q035 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm20425E9Q035 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm20425E9Q035 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm20425E9Q035 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm20425E9Q035 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm20425E9Q035 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm20425E9Q035 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm20425E9Q035 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm20425E9Q035 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gm20425E9Q035 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm20425E9Q035 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm20425E9Q035 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm20425E9Q035 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm20425E9Q035 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm20425E9Q035 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm20425E9Q035 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm20425E9Q035 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm20425E9Q035 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm20425E9Q035 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm20425E9Q035 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm20425E9Q035 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm20425E9Q035 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm20425E9Q035 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm20425E9Q035 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm20425E9Q035 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm20425E9Q035 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm20425E9Q035 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm20425E9Q035 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm20425E9Q035 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Gm20425E9Q035 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Gm20425E9Q035 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Gm20425E9Q035 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm20425E9Q035 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm20425E9Q035 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm20425E9Q035 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm20425E9Q035 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm20425E9Q035 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm20425E9Q035 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm20425E9Q035 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm20425E9Q035 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm20425E9Q035 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm20425E9Q035 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gm20425E9Q035 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm20425E9Q035 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm20425E9Q035 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm20425E9Q035 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm20425E9Q035 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm20425E9Q035 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm20425E9Q035 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm20425E9Q035 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm20425E9Q035 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gm20425E9Q035 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gm20425E9Q035 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm20425E9Q035 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm20425E9Q035 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm20425E9Q035 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm20425E9Q035 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm20425E9Q035 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm20425E9Q035 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm20425E9Q035 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm20425E9Q035 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm20425E9Q035 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm20425E9Q035 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm20425E9Q035 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm20425E9Q035 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm20425E9Q035 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm20425E9Q035 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm20425E9Q035 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm20425E9Q035 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm20425E9Q035 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm20425E9Q035 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm20425E9Q035 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm20425E9Q035 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gm20425E9Q035 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gm20425E9Q035 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gm20425E9Q035 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gm20425E9Q035 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gm20425E9Q035 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm20425E9Q035 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm20425E9Q035 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm20425E9Q035 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm20425E9Q035 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm20425E9Q035 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm20425E9Q035 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm20425E9Q035 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm20425E9Q035 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.5 ms