Protein–RNA interactions for Protein: E9PVJ0

Gm2956, Predicted gene 2956, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2956E9PVJ0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm2956E9PVJ0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm2956E9PVJ0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm2956E9PVJ0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm2956E9PVJ0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm2956E9PVJ0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm2956E9PVJ0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm2956E9PVJ0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm2956E9PVJ0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm2956E9PVJ0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm2956E9PVJ0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm2956E9PVJ0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm2956E9PVJ0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm2956E9PVJ0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm2956E9PVJ0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm2956E9PVJ0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm2956E9PVJ0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm2956E9PVJ0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm2956E9PVJ0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm2956E9PVJ0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm2956E9PVJ0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm2956E9PVJ0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm2956E9PVJ0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm2956E9PVJ0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm2956E9PVJ0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm2956E9PVJ0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm2956E9PVJ0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm2956E9PVJ0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm2956E9PVJ0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm2956E9PVJ0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm2956E9PVJ0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm2956E9PVJ0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm2956E9PVJ0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm2956E9PVJ0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm2956E9PVJ0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm2956E9PVJ0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm2956E9PVJ0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm2956E9PVJ0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm2956E9PVJ0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm2956E9PVJ0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm2956E9PVJ0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm2956E9PVJ0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm2956E9PVJ0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm2956E9PVJ0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm2956E9PVJ0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm2956E9PVJ0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm2956E9PVJ0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm2956E9PVJ0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm2956E9PVJ0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm2956E9PVJ0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm2956E9PVJ0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm2956E9PVJ0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm2956E9PVJ0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm2956E9PVJ0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm2956E9PVJ0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm2956E9PVJ0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm2956E9PVJ0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm2956E9PVJ0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm2956E9PVJ0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm2956E9PVJ0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm2956E9PVJ0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm2956E9PVJ0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm2956E9PVJ0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm2956E9PVJ0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm2956E9PVJ0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm2956E9PVJ0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm2956E9PVJ0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm2956E9PVJ0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm2956E9PVJ0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm2956E9PVJ0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm2956E9PVJ0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm2956E9PVJ0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm2956E9PVJ0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm2956E9PVJ0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm2956E9PVJ0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm2956E9PVJ0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm2956E9PVJ0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm2956E9PVJ0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm2956E9PVJ0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm2956E9PVJ0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm2956E9PVJ0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm2956E9PVJ0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm2956E9PVJ0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm2956E9PVJ0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm2956E9PVJ0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm2956E9PVJ0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm2956E9PVJ0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm2956E9PVJ0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm2956E9PVJ0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm2956E9PVJ0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm2956E9PVJ0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm2956E9PVJ0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm2956E9PVJ0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm2956E9PVJ0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm2956E9PVJ0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm2956E9PVJ0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm2956E9PVJ0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm2956E9PVJ0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm2956E9PVJ0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm2956E9PVJ0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms