Protein–RNA interactions for Protein: E9PUW8

Ccdc24, Coiled-coil domain-containing 24, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc24E9PUW8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc24E9PUW8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc24E9PUW8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc24E9PUW8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc24E9PUW8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc24E9PUW8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc24E9PUW8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc24E9PUW8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc24E9PUW8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc24E9PUW8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc24E9PUW8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc24E9PUW8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc24E9PUW8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc24E9PUW8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc24E9PUW8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc24E9PUW8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc24E9PUW8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc24E9PUW8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc24E9PUW8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc24E9PUW8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc24E9PUW8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc24E9PUW8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc24E9PUW8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc24E9PUW8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc24E9PUW8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc24E9PUW8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc24E9PUW8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc24E9PUW8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc24E9PUW8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc24E9PUW8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc24E9PUW8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc24E9PUW8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc24E9PUW8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc24E9PUW8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc24E9PUW8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc24E9PUW8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc24E9PUW8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc24E9PUW8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc24E9PUW8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc24E9PUW8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc24E9PUW8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc24E9PUW8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc24E9PUW8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc24E9PUW8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc24E9PUW8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc24E9PUW8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc24E9PUW8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc24E9PUW8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc24E9PUW8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc24E9PUW8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc24E9PUW8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc24E9PUW8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc24E9PUW8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc24E9PUW8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc24E9PUW8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc24E9PUW8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc24E9PUW8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc24E9PUW8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc24E9PUW8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc24E9PUW8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc24E9PUW8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc24E9PUW8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc24E9PUW8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc24E9PUW8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc24E9PUW8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc24E9PUW8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc24E9PUW8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc24E9PUW8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc24E9PUW8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc24E9PUW8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc24E9PUW8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc24E9PUW8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc24E9PUW8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc24E9PUW8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc24E9PUW8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc24E9PUW8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc24E9PUW8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc24E9PUW8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc24E9PUW8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc24E9PUW8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc24E9PUW8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc24E9PUW8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc24E9PUW8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc24E9PUW8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc24E9PUW8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc24E9PUW8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc24E9PUW8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc24E9PUW8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc24E9PUW8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc24E9PUW8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc24E9PUW8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc24E9PUW8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc24E9PUW8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc24E9PUW8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc24E9PUW8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc24E9PUW8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc24E9PUW8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc24E9PUW8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc24E9PUW8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc24E9PUW8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms