Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Syde2E9PUP1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
Syde2E9PUP1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
Syde2E9PUP1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Syde2E9PUP1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Syde2E9PUP1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Syde2E9PUP1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Syde2E9PUP1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Syde2E9PUP1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Syde2E9PUP1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Syde2E9PUP1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Syde2E9PUP1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Syde2E9PUP1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Syde2E9PUP1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Syde2E9PUP1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Syde2E9PUP1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Syde2E9PUP1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Syde2E9PUP1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Syde2E9PUP1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Syde2E9PUP1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Syde2E9PUP1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Syde2E9PUP1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Syde2E9PUP1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Syde2E9PUP1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Syde2E9PUP1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Syde2E9PUP1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Syde2E9PUP1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Syde2E9PUP1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Syde2E9PUP1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Syde2E9PUP1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Syde2E9PUP1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Syde2E9PUP1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Syde2E9PUP1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Syde2E9PUP1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Syde2E9PUP1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Syde2E9PUP1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Syde2E9PUP1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Syde2E9PUP1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Syde2E9PUP1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Syde2E9PUP1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Syde2E9PUP1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Syde2E9PUP1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Syde2E9PUP1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Syde2E9PUP1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Syde2E9PUP1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Syde2E9PUP1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Syde2E9PUP1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Syde2E9PUP1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Syde2E9PUP1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Syde2E9PUP1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Syde2E9PUP1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Syde2E9PUP1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Syde2E9PUP1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Syde2E9PUP1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Syde2E9PUP1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Syde2E9PUP1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Syde2E9PUP1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Syde2E9PUP1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Syde2E9PUP1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Syde2E9PUP1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Syde2E9PUP1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Syde2E9PUP1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Syde2E9PUP1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Syde2E9PUP1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Syde2E9PUP1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Syde2E9PUP1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Syde2E9PUP1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Syde2E9PUP1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Syde2E9PUP1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Syde2E9PUP1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Syde2E9PUP1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Syde2E9PUP1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Syde2E9PUP1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Syde2E9PUP1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Syde2E9PUP1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Syde2E9PUP1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Syde2E9PUP1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Syde2E9PUP1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Syde2E9PUP1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Syde2E9PUP1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Syde2E9PUP1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Syde2E9PUP1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Syde2E9PUP1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Syde2E9PUP1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Syde2E9PUP1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Syde2E9PUP1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Syde2E9PUP1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Syde2E9PUP1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Syde2E9PUP1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Syde2E9PUP1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Syde2E9PUP1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Syde2E9PUP1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Syde2E9PUP1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Syde2E9PUP1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Syde2E9PUP1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Syde2E9PUP1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Syde2E9PUP1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Syde2E9PUP1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Syde2E9PUP1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Syde2E9PUP1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms