Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T8

4930407I10Rik, RIKEN cDNA 4930407I10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930407I10RikD3Z5T8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
4930407I10RikD3Z5T8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
4930407I10RikD3Z5T8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
4930407I10RikD3Z5T8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
4930407I10RikD3Z5T8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
4930407I10RikD3Z5T8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
4930407I10RikD3Z5T8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
4930407I10RikD3Z5T8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
4930407I10RikD3Z5T8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
4930407I10RikD3Z5T8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
4930407I10RikD3Z5T8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
4930407I10RikD3Z5T8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
4930407I10RikD3Z5T8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
4930407I10RikD3Z5T8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
4930407I10RikD3Z5T8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
4930407I10RikD3Z5T8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
4930407I10RikD3Z5T8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
4930407I10RikD3Z5T8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
4930407I10RikD3Z5T8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
4930407I10RikD3Z5T8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
4930407I10RikD3Z5T8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
4930407I10RikD3Z5T8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
4930407I10RikD3Z5T8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
4930407I10RikD3Z5T8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
4930407I10RikD3Z5T8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
4930407I10RikD3Z5T8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
4930407I10RikD3Z5T8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
4930407I10RikD3Z5T8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
4930407I10RikD3Z5T8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
4930407I10RikD3Z5T8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
4930407I10RikD3Z5T8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
4930407I10RikD3Z5T8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
4930407I10RikD3Z5T8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
4930407I10RikD3Z5T8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
4930407I10RikD3Z5T8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
4930407I10RikD3Z5T8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
4930407I10RikD3Z5T8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
4930407I10RikD3Z5T8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
4930407I10RikD3Z5T8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
4930407I10RikD3Z5T8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
4930407I10RikD3Z5T8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
4930407I10RikD3Z5T8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
4930407I10RikD3Z5T8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
4930407I10RikD3Z5T8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
4930407I10RikD3Z5T8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
4930407I10RikD3Z5T8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
4930407I10RikD3Z5T8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
4930407I10RikD3Z5T8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
4930407I10RikD3Z5T8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
4930407I10RikD3Z5T8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
4930407I10RikD3Z5T8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
4930407I10RikD3Z5T8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
4930407I10RikD3Z5T8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
4930407I10RikD3Z5T8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
4930407I10RikD3Z5T8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
4930407I10RikD3Z5T8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
4930407I10RikD3Z5T8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
4930407I10RikD3Z5T8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
4930407I10RikD3Z5T8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
4930407I10RikD3Z5T8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
4930407I10RikD3Z5T8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
4930407I10RikD3Z5T8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
4930407I10RikD3Z5T8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
4930407I10RikD3Z5T8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
4930407I10RikD3Z5T8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
4930407I10RikD3Z5T8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
4930407I10RikD3Z5T8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
4930407I10RikD3Z5T8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
4930407I10RikD3Z5T8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
4930407I10RikD3Z5T8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
4930407I10RikD3Z5T8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
4930407I10RikD3Z5T8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
4930407I10RikD3Z5T8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
4930407I10RikD3Z5T8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
4930407I10RikD3Z5T8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
4930407I10RikD3Z5T8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
4930407I10RikD3Z5T8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
4930407I10RikD3Z5T8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
4930407I10RikD3Z5T8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
4930407I10RikD3Z5T8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
4930407I10RikD3Z5T8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
4930407I10RikD3Z5T8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
4930407I10RikD3Z5T8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
4930407I10RikD3Z5T8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
4930407I10RikD3Z5T8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
4930407I10RikD3Z5T8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
4930407I10RikD3Z5T8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
4930407I10RikD3Z5T8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
4930407I10RikD3Z5T8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
4930407I10RikD3Z5T8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
4930407I10RikD3Z5T8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
4930407I10RikD3Z5T8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
4930407I10RikD3Z5T8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
4930407I10RikD3Z5T8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
4930407I10RikD3Z5T8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
4930407I10RikD3Z5T8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
4930407I10RikD3Z5T8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
4930407I10RikD3Z5T8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms