Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kif28pD3YXS5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kif28pD3YXS5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kif28pD3YXS5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kif28pD3YXS5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kif28pD3YXS5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kif28pD3YXS5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kif28pD3YXS5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kif28pD3YXS5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kif28pD3YXS5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kif28pD3YXS5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kif28pD3YXS5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kif28pD3YXS5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kif28pD3YXS5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kif28pD3YXS5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kif28pD3YXS5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kif28pD3YXS5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kif28pD3YXS5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kif28pD3YXS5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kif28pD3YXS5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kif28pD3YXS5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kif28pD3YXS5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kif28pD3YXS5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kif28pD3YXS5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kif28pD3YXS5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kif28pD3YXS5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kif28pD3YXS5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kif28pD3YXS5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kif28pD3YXS5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kif28pD3YXS5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kif28pD3YXS5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kif28pD3YXS5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kif28pD3YXS5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kif28pD3YXS5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kif28pD3YXS5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kif28pD3YXS5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kif28pD3YXS5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kif28pD3YXS5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kif28pD3YXS5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kif28pD3YXS5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kif28pD3YXS5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kif28pD3YXS5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kif28pD3YXS5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kif28pD3YXS5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kif28pD3YXS5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kif28pD3YXS5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kif28pD3YXS5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kif28pD3YXS5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Kif28pD3YXS5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kif28pD3YXS5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Kif28pD3YXS5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Kif28pD3YXS5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kif28pD3YXS5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kif28pD3YXS5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kif28pD3YXS5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kif28pD3YXS5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kif28pD3YXS5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kif28pD3YXS5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kif28pD3YXS5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kif28pD3YXS5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kif28pD3YXS5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kif28pD3YXS5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kif28pD3YXS5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kif28pD3YXS5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kif28pD3YXS5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kif28pD3YXS5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kif28pD3YXS5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kif28pD3YXS5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Kif28pD3YXS5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kif28pD3YXS5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kif28pD3YXS5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kif28pD3YXS5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kif28pD3YXS5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kif28pD3YXS5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kif28pD3YXS5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kif28pD3YXS5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kif28pD3YXS5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kif28pD3YXS5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kif28pD3YXS5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kif28pD3YXS5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kif28pD3YXS5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Kif28pD3YXS5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Kif28pD3YXS5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kif28pD3YXS5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kif28pD3YXS5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kif28pD3YXS5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kif28pD3YXS5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kif28pD3YXS5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kif28pD3YXS5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kif28pD3YXS5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kif28pD3YXS5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kif28pD3YXS5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Kif28pD3YXS5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kif28pD3YXS5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kif28pD3YXS5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kif28pD3YXS5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kif28pD3YXS5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kif28pD3YXS5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Kif28pD3YXS5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kif28pD3YXS5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms