Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cyp26c1B2RXA7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cyp26c1B2RXA7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cyp26c1B2RXA7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cyp26c1B2RXA7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cyp26c1B2RXA7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cyp26c1B2RXA7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cyp26c1B2RXA7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cyp26c1B2RXA7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cyp26c1B2RXA7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cyp26c1B2RXA7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Cyp26c1B2RXA7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cyp26c1B2RXA7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cyp26c1B2RXA7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Cyp26c1B2RXA7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cyp26c1B2RXA7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cyp26c1B2RXA7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cyp26c1B2RXA7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cyp26c1B2RXA7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cyp26c1B2RXA7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cyp26c1B2RXA7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cyp26c1B2RXA7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cyp26c1B2RXA7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cyp26c1B2RXA7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cyp26c1B2RXA7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cyp26c1B2RXA7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cyp26c1B2RXA7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cyp26c1B2RXA7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cyp26c1B2RXA7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Cyp26c1B2RXA7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cyp26c1B2RXA7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cyp26c1B2RXA7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cyp26c1B2RXA7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cyp26c1B2RXA7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cyp26c1B2RXA7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cyp26c1B2RXA7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cyp26c1B2RXA7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cyp26c1B2RXA7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cyp26c1B2RXA7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cyp26c1B2RXA7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cyp26c1B2RXA7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cyp26c1B2RXA7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cyp26c1B2RXA7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Cyp26c1B2RXA7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cyp26c1B2RXA7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cyp26c1B2RXA7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cyp26c1B2RXA7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cyp26c1B2RXA7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cyp26c1B2RXA7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cyp26c1B2RXA7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cyp26c1B2RXA7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cyp26c1B2RXA7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cyp26c1B2RXA7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cyp26c1B2RXA7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cyp26c1B2RXA7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cyp26c1B2RXA7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cyp26c1B2RXA7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Cyp26c1B2RXA7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cyp26c1B2RXA7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Cyp26c1B2RXA7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cyp26c1B2RXA7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cyp26c1B2RXA7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cyp26c1B2RXA7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cyp26c1B2RXA7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cyp26c1B2RXA7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cyp26c1B2RXA7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Cyp26c1B2RXA7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cyp26c1B2RXA7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cyp26c1B2RXA7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cyp26c1B2RXA7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cyp26c1B2RXA7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cyp26c1B2RXA7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cyp26c1B2RXA7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cyp26c1B2RXA7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cyp26c1B2RXA7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cyp26c1B2RXA7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cyp26c1B2RXA7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cyp26c1B2RXA7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cyp26c1B2RXA7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cyp26c1B2RXA7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cyp26c1B2RXA7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cyp26c1B2RXA7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cyp26c1B2RXA7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cyp26c1B2RXA7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cyp26c1B2RXA7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Cyp26c1B2RXA7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cyp26c1B2RXA7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cyp26c1B2RXA7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cyp26c1B2RXA7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cyp26c1B2RXA7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cyp26c1B2RXA7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cyp26c1B2RXA7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cyp26c1B2RXA7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cyp26c1B2RXA7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cyp26c1B2RXA7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cyp26c1B2RXA7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Cyp26c1B2RXA7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cyp26c1B2RXA7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cyp26c1B2RXA7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms