Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prrt4B2RU40 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prrt4B2RU40 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prrt4B2RU40 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Prrt4B2RU40 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prrt4B2RU40 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prrt4B2RU40 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrt4B2RU40 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrt4B2RU40 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrt4B2RU40 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrt4B2RU40 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrt4B2RU40 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrt4B2RU40 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrt4B2RU40 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrt4B2RU40 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrt4B2RU40 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Prrt4B2RU40 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prrt4B2RU40 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prrt4B2RU40 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prrt4B2RU40 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Prrt4B2RU40 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prrt4B2RU40 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prrt4B2RU40 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prrt4B2RU40 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prrt4B2RU40 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prrt4B2RU40 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prrt4B2RU40 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prrt4B2RU40 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Prrt4B2RU40 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prrt4B2RU40 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prrt4B2RU40 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prrt4B2RU40 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prrt4B2RU40 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prrt4B2RU40 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prrt4B2RU40 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prrt4B2RU40 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prrt4B2RU40 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prrt4B2RU40 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prrt4B2RU40 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prrt4B2RU40 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prrt4B2RU40 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prrt4B2RU40 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prrt4B2RU40 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prrt4B2RU40 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prrt4B2RU40 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prrt4B2RU40 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prrt4B2RU40 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prrt4B2RU40 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prrt4B2RU40 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prrt4B2RU40 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prrt4B2RU40 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prrt4B2RU40 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prrt4B2RU40 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prrt4B2RU40 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prrt4B2RU40 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prrt4B2RU40 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrt4B2RU40 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrt4B2RU40 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrt4B2RU40 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prrt4B2RU40 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prrt4B2RU40 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prrt4B2RU40 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prrt4B2RU40 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prrt4B2RU40 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prrt4B2RU40 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prrt4B2RU40 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prrt4B2RU40 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prrt4B2RU40 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prrt4B2RU40 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prrt4B2RU40 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prrt4B2RU40 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prrt4B2RU40 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prrt4B2RU40 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prrt4B2RU40 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prrt4B2RU40 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prrt4B2RU40 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prrt4B2RU40 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prrt4B2RU40 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prrt4B2RU40 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prrt4B2RU40 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prrt4B2RU40 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prrt4B2RU40 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prrt4B2RU40 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prrt4B2RU40 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prrt4B2RU40 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prrt4B2RU40 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prrt4B2RU40 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prrt4B2RU40 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Prrt4B2RU40 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prrt4B2RU40 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prrt4B2RU40 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prrt4B2RU40 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prrt4B2RU40 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prrt4B2RU40 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prrt4B2RU40 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prrt4B2RU40 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prrt4B2RU40 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prrt4B2RU40 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prrt4B2RU40 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prrt4B2RU40 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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