Protein–RNA interactions for Protein: B1AXH1

Nhsl2, NHS-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl2B1AXH1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nhsl2B1AXH1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nhsl2B1AXH1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nhsl2B1AXH1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nhsl2B1AXH1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nhsl2B1AXH1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Nhsl2B1AXH1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nhsl2B1AXH1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nhsl2B1AXH1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nhsl2B1AXH1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nhsl2B1AXH1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nhsl2B1AXH1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nhsl2B1AXH1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nhsl2B1AXH1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nhsl2B1AXH1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nhsl2B1AXH1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nhsl2B1AXH1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nhsl2B1AXH1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nhsl2B1AXH1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nhsl2B1AXH1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nhsl2B1AXH1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nhsl2B1AXH1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nhsl2B1AXH1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nhsl2B1AXH1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nhsl2B1AXH1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nhsl2B1AXH1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nhsl2B1AXH1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nhsl2B1AXH1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nhsl2B1AXH1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nhsl2B1AXH1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nhsl2B1AXH1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nhsl2B1AXH1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nhsl2B1AXH1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nhsl2B1AXH1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nhsl2B1AXH1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nhsl2B1AXH1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nhsl2B1AXH1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nhsl2B1AXH1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nhsl2B1AXH1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nhsl2B1AXH1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nhsl2B1AXH1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nhsl2B1AXH1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nhsl2B1AXH1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nhsl2B1AXH1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nhsl2B1AXH1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nhsl2B1AXH1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nhsl2B1AXH1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nhsl2B1AXH1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nhsl2B1AXH1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nhsl2B1AXH1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nhsl2B1AXH1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nhsl2B1AXH1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Nhsl2B1AXH1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nhsl2B1AXH1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nhsl2B1AXH1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nhsl2B1AXH1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nhsl2B1AXH1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nhsl2B1AXH1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nhsl2B1AXH1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nhsl2B1AXH1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nhsl2B1AXH1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nhsl2B1AXH1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nhsl2B1AXH1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nhsl2B1AXH1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Nhsl2B1AXH1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nhsl2B1AXH1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nhsl2B1AXH1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nhsl2B1AXH1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nhsl2B1AXH1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nhsl2B1AXH1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nhsl2B1AXH1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nhsl2B1AXH1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nhsl2B1AXH1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nhsl2B1AXH1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nhsl2B1AXH1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nhsl2B1AXH1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nhsl2B1AXH1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nhsl2B1AXH1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nhsl2B1AXH1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nhsl2B1AXH1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nhsl2B1AXH1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nhsl2B1AXH1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nhsl2B1AXH1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nhsl2B1AXH1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nhsl2B1AXH1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nhsl2B1AXH1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nhsl2B1AXH1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nhsl2B1AXH1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nhsl2B1AXH1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nhsl2B1AXH1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nhsl2B1AXH1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nhsl2B1AXH1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nhsl2B1AXH1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nhsl2B1AXH1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nhsl2B1AXH1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nhsl2B1AXH1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nhsl2B1AXH1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nhsl2B1AXH1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nhsl2B1AXH1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nhsl2B1AXH1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms