Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf39A2RT81 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf39A2RT81 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf39A2RT81 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf39A2RT81 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf39A2RT81 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf39A2RT81 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf39A2RT81 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf39A2RT81 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf39A2RT81 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf39A2RT81 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf39A2RT81 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf39A2RT81 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf39A2RT81 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf39A2RT81 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf39A2RT81 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf39A2RT81 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf39A2RT81 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf39A2RT81 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf39A2RT81 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf39A2RT81 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf39A2RT81 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf39A2RT81 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf39A2RT81 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf39A2RT81 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf39A2RT81 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf39A2RT81 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf39A2RT81 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf39A2RT81 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf39A2RT81 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf39A2RT81 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf39A2RT81 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf39A2RT81 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf39A2RT81 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf39A2RT81 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf39A2RT81 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf39A2RT81 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf39A2RT81 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf39A2RT81 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf39A2RT81 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf39A2RT81 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf39A2RT81 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf39A2RT81 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf39A2RT81 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf39A2RT81 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf39A2RT81 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf39A2RT81 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf39A2RT81 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf39A2RT81 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf39A2RT81 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf39A2RT81 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf39A2RT81 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf39A2RT81 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf39A2RT81 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf39A2RT81 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf39A2RT81 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf39A2RT81 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf39A2RT81 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf39A2RT81 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf39A2RT81 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf39A2RT81 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf39A2RT81 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf39A2RT81 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf39A2RT81 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf39A2RT81 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf39A2RT81 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf39A2RT81 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf39A2RT81 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf39A2RT81 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf39A2RT81 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf39A2RT81 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf39A2RT81 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf39A2RT81 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf39A2RT81 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf39A2RT81 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf39A2RT81 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf39A2RT81 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf39A2RT81 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf39A2RT81 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf39A2RT81 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf39A2RT81 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf39A2RT81 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf39A2RT81 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf39A2RT81 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf39A2RT81 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf39A2RT81 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf39A2RT81 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf39A2RT81 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf39A2RT81 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf39A2RT81 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf39A2RT81 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf39A2RT81 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf39A2RT81 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf39A2RT81 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf39A2RT81 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf39A2RT81 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf39A2RT81 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf39A2RT81 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rnf39A2RT81 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf39A2RT81 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.5 ms