Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pramef17A2ASJ1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pramef17A2ASJ1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Pramef17A2ASJ1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Pramef17A2ASJ1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pramef17A2ASJ1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pramef17A2ASJ1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pramef17A2ASJ1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pramef17A2ASJ1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pramef17A2ASJ1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pramef17A2ASJ1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pramef17A2ASJ1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pramef17A2ASJ1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pramef17A2ASJ1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pramef17A2ASJ1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pramef17A2ASJ1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pramef17A2ASJ1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pramef17A2ASJ1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pramef17A2ASJ1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Pramef17A2ASJ1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Pramef17A2ASJ1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pramef17A2ASJ1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pramef17A2ASJ1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Pramef17A2ASJ1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pramef17A2ASJ1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pramef17A2ASJ1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pramef17A2ASJ1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pramef17A2ASJ1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pramef17A2ASJ1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pramef17A2ASJ1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pramef17A2ASJ1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pramef17A2ASJ1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Pramef17A2ASJ1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pramef17A2ASJ1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pramef17A2ASJ1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pramef17A2ASJ1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pramef17A2ASJ1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pramef17A2ASJ1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pramef17A2ASJ1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pramef17A2ASJ1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pramef17A2ASJ1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pramef17A2ASJ1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pramef17A2ASJ1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pramef17A2ASJ1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pramef17A2ASJ1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pramef17A2ASJ1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pramef17A2ASJ1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pramef17A2ASJ1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pramef17A2ASJ1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pramef17A2ASJ1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pramef17A2ASJ1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pramef17A2ASJ1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pramef17A2ASJ1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pramef17A2ASJ1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pramef17A2ASJ1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pramef17A2ASJ1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pramef17A2ASJ1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pramef17A2ASJ1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pramef17A2ASJ1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pramef17A2ASJ1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pramef17A2ASJ1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pramef17A2ASJ1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pramef17A2ASJ1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pramef17A2ASJ1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pramef17A2ASJ1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pramef17A2ASJ1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pramef17A2ASJ1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pramef17A2ASJ1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Pramef17A2ASJ1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pramef17A2ASJ1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pramef17A2ASJ1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pramef17A2ASJ1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pramef17A2ASJ1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pramef17A2ASJ1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pramef17A2ASJ1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pramef17A2ASJ1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pramef17A2ASJ1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pramef17A2ASJ1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pramef17A2ASJ1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pramef17A2ASJ1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pramef17A2ASJ1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Pramef17A2ASJ1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pramef17A2ASJ1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pramef17A2ASJ1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Pramef17A2ASJ1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pramef17A2ASJ1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pramef17A2ASJ1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pramef17A2ASJ1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pramef17A2ASJ1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pramef17A2ASJ1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pramef17A2ASJ1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pramef17A2ASJ1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pramef17A2ASJ1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pramef17A2ASJ1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pramef17A2ASJ1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pramef17A2ASJ1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pramef17A2ASJ1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pramef17A2ASJ1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pramef17A2ASJ1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Pramef17A2ASJ1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms