Protein–RNA interactions for Protein: A2ARK7

Samt3, Spermatogenesis-associated multipass transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt3A2ARK7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Samt3A2ARK7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Samt3A2ARK7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samt3A2ARK7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samt3A2ARK7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samt3A2ARK7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samt3A2ARK7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Samt3A2ARK7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Samt3A2ARK7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Samt3A2ARK7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Samt3A2ARK7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Samt3A2ARK7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samt3A2ARK7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samt3A2ARK7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samt3A2ARK7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samt3A2ARK7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samt3A2ARK7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samt3A2ARK7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samt3A2ARK7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samt3A2ARK7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samt3A2ARK7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samt3A2ARK7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samt3A2ARK7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samt3A2ARK7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samt3A2ARK7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samt3A2ARK7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samt3A2ARK7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samt3A2ARK7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samt3A2ARK7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samt3A2ARK7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samt3A2ARK7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Samt3A2ARK7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samt3A2ARK7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samt3A2ARK7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samt3A2ARK7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samt3A2ARK7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samt3A2ARK7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samt3A2ARK7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Samt3A2ARK7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samt3A2ARK7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samt3A2ARK7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samt3A2ARK7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samt3A2ARK7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samt3A2ARK7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samt3A2ARK7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samt3A2ARK7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samt3A2ARK7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Samt3A2ARK7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Samt3A2ARK7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samt3A2ARK7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samt3A2ARK7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samt3A2ARK7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samt3A2ARK7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samt3A2ARK7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samt3A2ARK7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samt3A2ARK7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samt3A2ARK7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Samt3A2ARK7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samt3A2ARK7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samt3A2ARK7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samt3A2ARK7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samt3A2ARK7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samt3A2ARK7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samt3A2ARK7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samt3A2ARK7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samt3A2ARK7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Samt3A2ARK7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samt3A2ARK7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samt3A2ARK7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samt3A2ARK7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samt3A2ARK7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Samt3A2ARK7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samt3A2ARK7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samt3A2ARK7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samt3A2ARK7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samt3A2ARK7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samt3A2ARK7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samt3A2ARK7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samt3A2ARK7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samt3A2ARK7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samt3A2ARK7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samt3A2ARK7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samt3A2ARK7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samt3A2ARK7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samt3A2ARK7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samt3A2ARK7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samt3A2ARK7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samt3A2ARK7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samt3A2ARK7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samt3A2ARK7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Samt3A2ARK7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samt3A2ARK7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samt3A2ARK7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samt3A2ARK7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samt3A2ARK7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samt3A2ARK7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samt3A2ARK7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samt3A2ARK7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samt3A2ARK7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samt3A2ARK7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms