Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930447F04RikA2AFR2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930447F04RikA2AFR2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930447F04RikA2AFR2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930447F04RikA2AFR2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930447F04RikA2AFR2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930447F04RikA2AFR2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930447F04RikA2AFR2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930447F04RikA2AFR2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930447F04RikA2AFR2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
4930447F04RikA2AFR2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930447F04RikA2AFR2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930447F04RikA2AFR2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930447F04RikA2AFR2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930447F04RikA2AFR2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930447F04RikA2AFR2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930447F04RikA2AFR2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930447F04RikA2AFR2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930447F04RikA2AFR2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930447F04RikA2AFR2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930447F04RikA2AFR2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930447F04RikA2AFR2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930447F04RikA2AFR2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930447F04RikA2AFR2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930447F04RikA2AFR2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930447F04RikA2AFR2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930447F04RikA2AFR2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
4930447F04RikA2AFR2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930447F04RikA2AFR2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
4930447F04RikA2AFR2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930447F04RikA2AFR2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930447F04RikA2AFR2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930447F04RikA2AFR2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930447F04RikA2AFR2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930447F04RikA2AFR2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930447F04RikA2AFR2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930447F04RikA2AFR2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930447F04RikA2AFR2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930447F04RikA2AFR2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
4930447F04RikA2AFR2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930447F04RikA2AFR2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930447F04RikA2AFR2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930447F04RikA2AFR2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930447F04RikA2AFR2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930447F04RikA2AFR2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930447F04RikA2AFR2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930447F04RikA2AFR2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930447F04RikA2AFR2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930447F04RikA2AFR2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930447F04RikA2AFR2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930447F04RikA2AFR2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930447F04RikA2AFR2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930447F04RikA2AFR2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930447F04RikA2AFR2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930447F04RikA2AFR2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930447F04RikA2AFR2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930447F04RikA2AFR2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930447F04RikA2AFR2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930447F04RikA2AFR2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930447F04RikA2AFR2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930447F04RikA2AFR2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930447F04RikA2AFR2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930447F04RikA2AFR2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
4930447F04RikA2AFR2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930447F04RikA2AFR2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930447F04RikA2AFR2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930447F04RikA2AFR2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930447F04RikA2AFR2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930447F04RikA2AFR2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930447F04RikA2AFR2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930447F04RikA2AFR2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930447F04RikA2AFR2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930447F04RikA2AFR2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930447F04RikA2AFR2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930447F04RikA2AFR2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930447F04RikA2AFR2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930447F04RikA2AFR2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930447F04RikA2AFR2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930447F04RikA2AFR2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930447F04RikA2AFR2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930447F04RikA2AFR2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930447F04RikA2AFR2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
4930447F04RikA2AFR2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930447F04RikA2AFR2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930447F04RikA2AFR2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930447F04RikA2AFR2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930447F04RikA2AFR2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930447F04RikA2AFR2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930447F04RikA2AFR2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930447F04RikA2AFR2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930447F04RikA2AFR2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930447F04RikA2AFR2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930447F04RikA2AFR2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930447F04RikA2AFR2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930447F04RikA2AFR2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930447F04RikA2AFR2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930447F04RikA2AFR2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930447F04RikA2AFR2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930447F04RikA2AFR2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930447F04RikA2AFR2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms