Protein–RNA interactions for Protein: A2A559

Pgap3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgap3A2A559 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pgap3A2A559 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pgap3A2A559 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pgap3A2A559 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pgap3A2A559 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pgap3A2A559 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pgap3A2A559 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pgap3A2A559 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pgap3A2A559 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pgap3A2A559 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pgap3A2A559 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pgap3A2A559 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pgap3A2A559 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Pgap3A2A559 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pgap3A2A559 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pgap3A2A559 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pgap3A2A559 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pgap3A2A559 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pgap3A2A559 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pgap3A2A559 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pgap3A2A559 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pgap3A2A559 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pgap3A2A559 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pgap3A2A559 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pgap3A2A559 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pgap3A2A559 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pgap3A2A559 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pgap3A2A559 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pgap3A2A559 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pgap3A2A559 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Pgap3A2A559 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pgap3A2A559 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pgap3A2A559 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pgap3A2A559 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pgap3A2A559 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pgap3A2A559 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pgap3A2A559 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pgap3A2A559 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pgap3A2A559 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pgap3A2A559 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pgap3A2A559 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pgap3A2A559 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pgap3A2A559 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pgap3A2A559 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pgap3A2A559 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pgap3A2A559 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pgap3A2A559 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pgap3A2A559 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pgap3A2A559 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pgap3A2A559 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pgap3A2A559 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pgap3A2A559 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pgap3A2A559 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pgap3A2A559 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pgap3A2A559 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pgap3A2A559 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pgap3A2A559 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pgap3A2A559 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pgap3A2A559 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Pgap3A2A559 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pgap3A2A559 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pgap3A2A559 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pgap3A2A559 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pgap3A2A559 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pgap3A2A559 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pgap3A2A559 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pgap3A2A559 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pgap3A2A559 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pgap3A2A559 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pgap3A2A559 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pgap3A2A559 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pgap3A2A559 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pgap3A2A559 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pgap3A2A559 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pgap3A2A559 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pgap3A2A559 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pgap3A2A559 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pgap3A2A559 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pgap3A2A559 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Pgap3A2A559 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pgap3A2A559 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Pgap3A2A559 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pgap3A2A559 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pgap3A2A559 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pgap3A2A559 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pgap3A2A559 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pgap3A2A559 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Pgap3A2A559 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pgap3A2A559 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pgap3A2A559 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pgap3A2A559 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pgap3A2A559 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pgap3A2A559 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pgap3A2A559 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pgap3A2A559 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pgap3A2A559 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pgap3A2A559 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Pgap3A2A559 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pgap3A2A559 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pgap3A2A559 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms