Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDU1

Uncharacterized protein, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A286YDU1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
A0A286YDU1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
A0A286YDU1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
A0A286YDU1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
A0A286YDU1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
A0A286YDU1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
A0A286YDU1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
A0A286YDU1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
A0A286YDU1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
A0A286YDU1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
A0A286YDU1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
A0A286YDU1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
A0A286YDU1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
A0A286YDU1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
A0A286YDU1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
A0A286YDU1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
A0A286YDU1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
A0A286YDU1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
A0A286YDU1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
A0A286YDU1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
A0A286YDU1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
A0A286YDU1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
A0A286YDU1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
A0A286YDU1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
A0A286YDU1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
A0A286YDU1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
A0A286YDU1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
A0A286YDU1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
A0A286YDU1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
A0A286YDU1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
A0A286YDU1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
A0A286YDU1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
A0A286YDU1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
A0A286YDU1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
A0A286YDU1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
A0A286YDU1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
A0A286YDU1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
A0A286YDU1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
A0A286YDU1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
A0A286YDU1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
A0A286YDU1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
A0A286YDU1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
A0A286YDU1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
A0A286YDU1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
A0A286YDU1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
A0A286YDU1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
A0A286YDU1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
A0A286YDU1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
A0A286YDU1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
A0A286YDU1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
A0A286YDU1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
A0A286YDU1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
A0A286YDU1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
A0A286YDU1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
A0A286YDU1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
A0A286YDU1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
A0A286YDU1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
A0A286YDU1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
A0A286YDU1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
A0A286YDU1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
A0A286YDU1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
A0A286YDU1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
A0A286YDU1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
A0A286YDU1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
A0A286YDU1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
A0A286YDU1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
A0A286YDU1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
A0A286YDU1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
A0A286YDU1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
A0A286YDU1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
A0A286YDU1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
A0A286YDU1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A0A286YDU1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A0A286YDU1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A0A286YDU1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
A0A286YDU1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
A0A286YDU1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A286YDU1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A286YDU1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A286YDU1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A0A286YDU1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A0A286YDU1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A0A286YDU1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A0A286YDU1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A0A286YDU1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A0A286YDU1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
A0A286YDU1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
A0A286YDU1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A0A286YDU1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A0A286YDU1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A0A286YDU1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A0A286YDU1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A0A286YDU1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A0A286YDU1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A0A286YDU1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A0A286YDU1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A0A286YDU1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A0A286YDU1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A0A286YDU1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A0A286YDU1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms