Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H0

Trbv12-1, T cell receptor beta, variable 12-1 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trbv12-1A0A0B4J1H0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv12-1A0A0B4J1H0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trbv12-1A0A0B4J1H0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trbv12-1A0A0B4J1H0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trbv12-1A0A0B4J1H0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trbv12-1A0A0B4J1H0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trbv12-1A0A0B4J1H0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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