Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXJ1

Gm3952, Predicted gene 3952 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3952A0A0A6YXJ1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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Gm3952A0A0A6YXJ1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3952A0A0A6YXJ1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3952A0A0A6YXJ1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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Gm3952A0A0A6YXJ1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Gm3952A0A0A6YXJ1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3952A0A0A6YXJ1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Gm3952A0A0A6YXJ1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Gm3952A0A0A6YXJ1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Gm3952A0A0A6YXJ1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Gm3952A0A0A6YXJ1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3952A0A0A6YXJ1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3952A0A0A6YXJ1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm3952A0A0A6YXJ1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm3952A0A0A6YXJ1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Gm3952A0A0A6YXJ1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3952A0A0A6YXJ1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3952A0A0A6YXJ1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3952A0A0A6YXJ1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3952A0A0A6YXJ1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3952A0A0A6YXJ1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3952A0A0A6YXJ1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3952A0A0A6YXJ1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3952A0A0A6YXJ1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3952A0A0A6YXJ1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3952A0A0A6YXJ1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3952A0A0A6YXJ1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Gm3952A0A0A6YXJ1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Gm3952A0A0A6YXJ1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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