Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIF1AQ16665 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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