Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cnga1P29974 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms