Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms