Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cnga1P29974 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnga1P29974 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cnga1P29974 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnga1P29974 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnga1P29974 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnga1P29974 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnga1P29974 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnga1P29974 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cnga1P29974 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnga1P29974 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnga1P29974 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnga1P29974 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnga1P29974 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga1P29974 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga1P29974 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga1P29974 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga1P29974 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga1P29974 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga1P29974 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga1P29974 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cnga1P29974 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cnga1P29974 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga1P29974 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga1P29974 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga1P29974 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga1P29974 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga1P29974 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga1P29974 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga1P29974 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cnga1P29974 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga1P29974 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga1P29974 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga1P29974 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga1P29974 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga1P29974 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga1P29974 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga1P29974 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga1P29974 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga1P29974 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga1P29974 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cnga1P29974 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cnga1P29974 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga1P29974 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga1P29974 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga1P29974 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga1P29974 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga1P29974 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga1P29974 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga1P29974 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga1P29974 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga1P29974 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga1P29974 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga1P29974 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga1P29974 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga1P29974 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga1P29974 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga1P29974 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga1P29974 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga1P29974 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga1P29974 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga1P29974 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga1P29974 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga1P29974 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga1P29974 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga1P29974 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga1P29974 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga1P29974 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga1P29974 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga1P29974 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga1P29974 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga1P29974 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga1P29974 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga1P29974 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga1P29974 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga1P29974 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cnga1P29974 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga1P29974 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga1P29974 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga1P29974 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga1P29974 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga1P29974 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga1P29974 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnga1P29974 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnga1P29974 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnga1P29974 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cnga1P29974 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnga1P29974 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnga1P29974 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cnga1P29974 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cnga1P29974 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnga1P29974 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnga1P29974 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnga1P29974 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnga1P29974 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnga1P29974 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnga1P29974 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cnga1P29974 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnga1P29974 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnga1P29974 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms