Protein–RNA interactions for Protein: P09405

Ncl, Nucleolin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NclP09405 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NclP09405 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NclP09405 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NclP09405 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NclP09405 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NclP09405 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NclP09405 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NclP09405 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NclP09405 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NclP09405 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NclP09405 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NclP09405 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NclP09405 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NclP09405 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NclP09405 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NclP09405 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NclP09405 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NclP09405 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NclP09405 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NclP09405 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NclP09405 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NclP09405 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NclP09405 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NclP09405 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NclP09405 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NclP09405 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NclP09405 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NclP09405 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NclP09405 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NclP09405 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NclP09405 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NclP09405 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NclP09405 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NclP09405 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NclP09405 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NclP09405 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NclP09405 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NclP09405 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NclP09405 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NclP09405 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NclP09405 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NclP09405 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NclP09405 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NclP09405 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NclP09405 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NclP09405 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NclP09405 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NclP09405 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NclP09405 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NclP09405 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NclP09405 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NclP09405 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NclP09405 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NclP09405 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NclP09405 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NclP09405 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NclP09405 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NclP09405 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NclP09405 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NclP09405 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NclP09405 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NclP09405 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NclP09405 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NclP09405 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NclP09405 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NclP09405 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NclP09405 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NclP09405 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NclP09405 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NclP09405 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NclP09405 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NclP09405 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NclP09405 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NclP09405 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NclP09405 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NclP09405 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NclP09405 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NclP09405 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NclP09405 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NclP09405 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NclP09405 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NclP09405 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NclP09405 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NclP09405 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NclP09405 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NclP09405 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NclP09405 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NclP09405 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NclP09405 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NclP09405 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NclP09405 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NclP09405 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NclP09405 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NclP09405 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NclP09405 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NclP09405 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NclP09405 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NclP09405 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NclP09405 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NclP09405 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.4 ms