Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms