Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vstm4T1NXB5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vstm4T1NXB5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vstm4T1NXB5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vstm4T1NXB5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vstm4T1NXB5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vstm4T1NXB5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vstm4T1NXB5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Vstm4T1NXB5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vstm4T1NXB5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vstm4T1NXB5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vstm4T1NXB5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vstm4T1NXB5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vstm4T1NXB5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vstm4T1NXB5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vstm4T1NXB5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vstm4T1NXB5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vstm4T1NXB5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vstm4T1NXB5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vstm4T1NXB5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vstm4T1NXB5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Vstm4T1NXB5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Vstm4T1NXB5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Vstm4T1NXB5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vstm4T1NXB5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vstm4T1NXB5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vstm4T1NXB5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vstm4T1NXB5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vstm4T1NXB5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vstm4T1NXB5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Vstm4T1NXB5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vstm4T1NXB5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vstm4T1NXB5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vstm4T1NXB5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vstm4T1NXB5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vstm4T1NXB5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vstm4T1NXB5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vstm4T1NXB5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vstm4T1NXB5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vstm4T1NXB5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vstm4T1NXB5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vstm4T1NXB5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vstm4T1NXB5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vstm4T1NXB5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vstm4T1NXB5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vstm4T1NXB5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vstm4T1NXB5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vstm4T1NXB5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vstm4T1NXB5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vstm4T1NXB5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vstm4T1NXB5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vstm4T1NXB5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vstm4T1NXB5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vstm4T1NXB5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vstm4T1NXB5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vstm4T1NXB5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vstm4T1NXB5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vstm4T1NXB5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vstm4T1NXB5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vstm4T1NXB5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vstm4T1NXB5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vstm4T1NXB5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vstm4T1NXB5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vstm4T1NXB5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vstm4T1NXB5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vstm4T1NXB5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vstm4T1NXB5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Vstm4T1NXB5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vstm4T1NXB5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vstm4T1NXB5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vstm4T1NXB5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vstm4T1NXB5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vstm4T1NXB5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vstm4T1NXB5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vstm4T1NXB5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vstm4T1NXB5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Vstm4T1NXB5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vstm4T1NXB5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vstm4T1NXB5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vstm4T1NXB5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vstm4T1NXB5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vstm4T1NXB5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vstm4T1NXB5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vstm4T1NXB5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vstm4T1NXB5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vstm4T1NXB5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vstm4T1NXB5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vstm4T1NXB5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vstm4T1NXB5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vstm4T1NXB5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vstm4T1NXB5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vstm4T1NXB5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vstm4T1NXB5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vstm4T1NXB5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vstm4T1NXB5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vstm4T1NXB5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vstm4T1NXB5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vstm4T1NXB5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vstm4T1NXB5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vstm4T1NXB5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms