Protein–RNA interactions for Protein: S4R1R7

Rpl9-ps1, MCG50795, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl9-ps1S4R1R7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpl9-ps1S4R1R7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpl9-ps1S4R1R7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpl9-ps1S4R1R7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpl9-ps1S4R1R7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpl9-ps1S4R1R7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpl9-ps1S4R1R7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpl9-ps1S4R1R7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpl9-ps1S4R1R7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpl9-ps1S4R1R7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpl9-ps1S4R1R7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpl9-ps1S4R1R7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpl9-ps1S4R1R7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpl9-ps1S4R1R7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpl9-ps1S4R1R7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpl9-ps1S4R1R7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpl9-ps1S4R1R7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpl9-ps1S4R1R7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpl9-ps1S4R1R7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpl9-ps1S4R1R7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpl9-ps1S4R1R7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpl9-ps1S4R1R7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpl9-ps1S4R1R7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpl9-ps1S4R1R7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpl9-ps1S4R1R7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpl9-ps1S4R1R7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpl9-ps1S4R1R7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Rpl9-ps1S4R1R7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rpl9-ps1S4R1R7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpl9-ps1S4R1R7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpl9-ps1S4R1R7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpl9-ps1S4R1R7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpl9-ps1S4R1R7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpl9-ps1S4R1R7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpl9-ps1S4R1R7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpl9-ps1S4R1R7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpl9-ps1S4R1R7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpl9-ps1S4R1R7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpl9-ps1S4R1R7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpl9-ps1S4R1R7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpl9-ps1S4R1R7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpl9-ps1S4R1R7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpl9-ps1S4R1R7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpl9-ps1S4R1R7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpl9-ps1S4R1R7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpl9-ps1S4R1R7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpl9-ps1S4R1R7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpl9-ps1S4R1R7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpl9-ps1S4R1R7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpl9-ps1S4R1R7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpl9-ps1S4R1R7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpl9-ps1S4R1R7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpl9-ps1S4R1R7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpl9-ps1S4R1R7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpl9-ps1S4R1R7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpl9-ps1S4R1R7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpl9-ps1S4R1R7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpl9-ps1S4R1R7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpl9-ps1S4R1R7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpl9-ps1S4R1R7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpl9-ps1S4R1R7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpl9-ps1S4R1R7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpl9-ps1S4R1R7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpl9-ps1S4R1R7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpl9-ps1S4R1R7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpl9-ps1S4R1R7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpl9-ps1S4R1R7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpl9-ps1S4R1R7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpl9-ps1S4R1R7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpl9-ps1S4R1R7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rpl9-ps1S4R1R7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpl9-ps1S4R1R7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpl9-ps1S4R1R7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpl9-ps1S4R1R7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpl9-ps1S4R1R7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpl9-ps1S4R1R7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpl9-ps1S4R1R7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpl9-ps1S4R1R7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpl9-ps1S4R1R7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpl9-ps1S4R1R7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpl9-ps1S4R1R7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpl9-ps1S4R1R7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpl9-ps1S4R1R7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpl9-ps1S4R1R7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpl9-ps1S4R1R7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpl9-ps1S4R1R7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpl9-ps1S4R1R7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpl9-ps1S4R1R7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpl9-ps1S4R1R7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rpl9-ps1S4R1R7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpl9-ps1S4R1R7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms