Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cldn7Q9Z261 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldn7Q9Z261 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldn7Q9Z261 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldn7Q9Z261 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn7Q9Z261 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn7Q9Z261 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn7Q9Z261 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn7Q9Z261 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn7Q9Z261 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn7Q9Z261 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn7Q9Z261 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cldn7Q9Z261 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cldn7Q9Z261 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cldn7Q9Z261 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldn7Q9Z261 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldn7Q9Z261 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldn7Q9Z261 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldn7Q9Z261 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldn7Q9Z261 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cldn7Q9Z261 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldn7Q9Z261 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldn7Q9Z261 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldn7Q9Z261 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldn7Q9Z261 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldn7Q9Z261 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cldn7Q9Z261 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cldn7Q9Z261 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cldn7Q9Z261 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cldn7Q9Z261 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cldn7Q9Z261 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn7Q9Z261 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn7Q9Z261 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn7Q9Z261 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn7Q9Z261 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn7Q9Z261 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn7Q9Z261 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn7Q9Z261 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn7Q9Z261 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn7Q9Z261 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn7Q9Z261 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cldn7Q9Z261 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cldn7Q9Z261 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cldn7Q9Z261 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cldn7Q9Z261 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cldn7Q9Z261 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cldn7Q9Z261 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldn7Q9Z261 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldn7Q9Z261 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldn7Q9Z261 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldn7Q9Z261 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldn7Q9Z261 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cldn7Q9Z261 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cldn7Q9Z261 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cldn7Q9Z261 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cldn7Q9Z261 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cldn7Q9Z261 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cldn7Q9Z261 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn7Q9Z261 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn7Q9Z261 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn7Q9Z261 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn7Q9Z261 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn7Q9Z261 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cldn7Q9Z261 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cldn7Q9Z261 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cldn7Q9Z261 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cldn7Q9Z261 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cldn7Q9Z261 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cldn7Q9Z261 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cldn7Q9Z261 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cldn7Q9Z261 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cldn7Q9Z261 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cldn7Q9Z261 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cldn7Q9Z261 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldn7Q9Z261 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldn7Q9Z261 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldn7Q9Z261 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldn7Q9Z261 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldn7Q9Z261 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldn7Q9Z261 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldn7Q9Z261 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn7Q9Z261 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn7Q9Z261 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn7Q9Z261 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cldn7Q9Z261 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cldn7Q9Z261 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cldn7Q9Z261 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cldn7Q9Z261 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cldn7Q9Z261 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn7Q9Z261 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn7Q9Z261 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn7Q9Z261 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn7Q9Z261 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn7Q9Z261 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn7Q9Z261 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cldn7Q9Z261 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cldn7Q9Z261 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cldn7Q9Z261 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cldn7Q9Z261 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cldn7Q9Z261 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms