Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Uso1Q9Z1Z0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Uso1Q9Z1Z0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Uso1Q9Z1Z0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Uso1Q9Z1Z0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uso1Q9Z1Z0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uso1Q9Z1Z0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uso1Q9Z1Z0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uso1Q9Z1Z0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Uso1Q9Z1Z0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Uso1Q9Z1Z0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Uso1Q9Z1Z0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Uso1Q9Z1Z0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Uso1Q9Z1Z0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Uso1Q9Z1Z0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Uso1Q9Z1Z0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Uso1Q9Z1Z0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Uso1Q9Z1Z0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Uso1Q9Z1Z0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Uso1Q9Z1Z0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Uso1Q9Z1Z0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Uso1Q9Z1Z0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Uso1Q9Z1Z0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Uso1Q9Z1Z0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Uso1Q9Z1Z0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Uso1Q9Z1Z0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Uso1Q9Z1Z0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Uso1Q9Z1Z0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Uso1Q9Z1Z0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Uso1Q9Z1Z0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Uso1Q9Z1Z0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Uso1Q9Z1Z0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Uso1Q9Z1Z0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Uso1Q9Z1Z0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Uso1Q9Z1Z0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Uso1Q9Z1Z0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Uso1Q9Z1Z0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Uso1Q9Z1Z0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Uso1Q9Z1Z0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Uso1Q9Z1Z0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Uso1Q9Z1Z0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Uso1Q9Z1Z0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Uso1Q9Z1Z0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Uso1Q9Z1Z0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Uso1Q9Z1Z0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Uso1Q9Z1Z0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Uso1Q9Z1Z0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Uso1Q9Z1Z0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Uso1Q9Z1Z0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Uso1Q9Z1Z0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Uso1Q9Z1Z0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Uso1Q9Z1Z0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Uso1Q9Z1Z0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Uso1Q9Z1Z0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Uso1Q9Z1Z0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Uso1Q9Z1Z0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Uso1Q9Z1Z0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Uso1Q9Z1Z0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Uso1Q9Z1Z0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Uso1Q9Z1Z0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Uso1Q9Z1Z0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Uso1Q9Z1Z0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Uso1Q9Z1Z0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Uso1Q9Z1Z0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Uso1Q9Z1Z0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uso1Q9Z1Z0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uso1Q9Z1Z0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uso1Q9Z1Z0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uso1Q9Z1Z0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uso1Q9Z1Z0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uso1Q9Z1Z0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uso1Q9Z1Z0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uso1Q9Z1Z0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uso1Q9Z1Z0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uso1Q9Z1Z0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uso1Q9Z1Z0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uso1Q9Z1Z0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Uso1Q9Z1Z0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Uso1Q9Z1Z0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Uso1Q9Z1Z0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Uso1Q9Z1Z0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Uso1Q9Z1Z0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Uso1Q9Z1Z0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Uso1Q9Z1Z0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Uso1Q9Z1Z0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Uso1Q9Z1Z0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Uso1Q9Z1Z0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Uso1Q9Z1Z0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Uso1Q9Z1Z0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Uso1Q9Z1Z0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Uso1Q9Z1Z0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Uso1Q9Z1Z0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Uso1Q9Z1Z0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Uso1Q9Z1Z0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Uso1Q9Z1Z0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Uso1Q9Z1Z0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Uso1Q9Z1Z0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Uso1Q9Z1Z0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Uso1Q9Z1Z0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Uso1Q9Z1Z0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms