Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stub1Q9WUD1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stub1Q9WUD1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Stub1Q9WUD1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stub1Q9WUD1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stub1Q9WUD1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stub1Q9WUD1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Stub1Q9WUD1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stub1Q9WUD1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stub1Q9WUD1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stub1Q9WUD1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stub1Q9WUD1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stub1Q9WUD1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stub1Q9WUD1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stub1Q9WUD1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stub1Q9WUD1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stub1Q9WUD1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stub1Q9WUD1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stub1Q9WUD1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stub1Q9WUD1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stub1Q9WUD1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stub1Q9WUD1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stub1Q9WUD1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stub1Q9WUD1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stub1Q9WUD1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stub1Q9WUD1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stub1Q9WUD1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stub1Q9WUD1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stub1Q9WUD1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stub1Q9WUD1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Stub1Q9WUD1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Stub1Q9WUD1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stub1Q9WUD1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stub1Q9WUD1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stub1Q9WUD1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stub1Q9WUD1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stub1Q9WUD1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stub1Q9WUD1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stub1Q9WUD1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stub1Q9WUD1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stub1Q9WUD1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stub1Q9WUD1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Stub1Q9WUD1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stub1Q9WUD1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stub1Q9WUD1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stub1Q9WUD1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stub1Q9WUD1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stub1Q9WUD1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stub1Q9WUD1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stub1Q9WUD1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stub1Q9WUD1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stub1Q9WUD1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stub1Q9WUD1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stub1Q9WUD1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stub1Q9WUD1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stub1Q9WUD1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stub1Q9WUD1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Stub1Q9WUD1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stub1Q9WUD1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stub1Q9WUD1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stub1Q9WUD1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stub1Q9WUD1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stub1Q9WUD1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stub1Q9WUD1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stub1Q9WUD1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stub1Q9WUD1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stub1Q9WUD1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stub1Q9WUD1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stub1Q9WUD1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stub1Q9WUD1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stub1Q9WUD1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stub1Q9WUD1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stub1Q9WUD1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Stub1Q9WUD1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stub1Q9WUD1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stub1Q9WUD1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stub1Q9WUD1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stub1Q9WUD1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stub1Q9WUD1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stub1Q9WUD1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stub1Q9WUD1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stub1Q9WUD1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stub1Q9WUD1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stub1Q9WUD1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stub1Q9WUD1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stub1Q9WUD1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stub1Q9WUD1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Stub1Q9WUD1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stub1Q9WUD1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stub1Q9WUD1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Stub1Q9WUD1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Stub1Q9WUD1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stub1Q9WUD1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stub1Q9WUD1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stub1Q9WUD1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stub1Q9WUD1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stub1Q9WUD1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stub1Q9WUD1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stub1Q9WUD1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stub1Q9WUD1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.9 ms