Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUB0

Rbck1, RanBP-type and C3HC4-type zinc finger-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbck1Q9WUB0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbck1Q9WUB0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbck1Q9WUB0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbck1Q9WUB0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbck1Q9WUB0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbck1Q9WUB0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbck1Q9WUB0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbck1Q9WUB0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbck1Q9WUB0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbck1Q9WUB0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbck1Q9WUB0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbck1Q9WUB0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbck1Q9WUB0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbck1Q9WUB0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbck1Q9WUB0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbck1Q9WUB0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbck1Q9WUB0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbck1Q9WUB0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbck1Q9WUB0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbck1Q9WUB0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbck1Q9WUB0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbck1Q9WUB0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rbck1Q9WUB0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbck1Q9WUB0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbck1Q9WUB0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbck1Q9WUB0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbck1Q9WUB0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbck1Q9WUB0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbck1Q9WUB0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbck1Q9WUB0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbck1Q9WUB0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbck1Q9WUB0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbck1Q9WUB0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbck1Q9WUB0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbck1Q9WUB0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbck1Q9WUB0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbck1Q9WUB0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbck1Q9WUB0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbck1Q9WUB0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbck1Q9WUB0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbck1Q9WUB0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbck1Q9WUB0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbck1Q9WUB0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbck1Q9WUB0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbck1Q9WUB0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbck1Q9WUB0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbck1Q9WUB0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbck1Q9WUB0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbck1Q9WUB0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbck1Q9WUB0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbck1Q9WUB0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbck1Q9WUB0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbck1Q9WUB0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbck1Q9WUB0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbck1Q9WUB0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbck1Q9WUB0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbck1Q9WUB0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbck1Q9WUB0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbck1Q9WUB0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbck1Q9WUB0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbck1Q9WUB0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbck1Q9WUB0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbck1Q9WUB0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbck1Q9WUB0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbck1Q9WUB0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbck1Q9WUB0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbck1Q9WUB0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbck1Q9WUB0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbck1Q9WUB0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbck1Q9WUB0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbck1Q9WUB0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbck1Q9WUB0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbck1Q9WUB0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbck1Q9WUB0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbck1Q9WUB0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbck1Q9WUB0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbck1Q9WUB0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbck1Q9WUB0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbck1Q9WUB0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbck1Q9WUB0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbck1Q9WUB0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbck1Q9WUB0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbck1Q9WUB0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbck1Q9WUB0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbck1Q9WUB0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbck1Q9WUB0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbck1Q9WUB0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbck1Q9WUB0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbck1Q9WUB0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbck1Q9WUB0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbck1Q9WUB0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbck1Q9WUB0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbck1Q9WUB0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbck1Q9WUB0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbck1Q9WUB0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbck1Q9WUB0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbck1Q9WUB0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbck1Q9WUB0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbck1Q9WUB0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbck1Q9WUB0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms