Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1X5

Abcc5, Multidrug resistance-associated protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc5Q9R1X5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Abcc5Q9R1X5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Abcc5Q9R1X5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Abcc5Q9R1X5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
Abcc5Q9R1X5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Abcc5Q9R1X5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Abcc5Q9R1X5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Abcc5Q9R1X5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Abcc5Q9R1X5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Abcc5Q9R1X5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Abcc5Q9R1X5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Abcc5Q9R1X5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Abcc5Q9R1X5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Abcc5Q9R1X5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Abcc5Q9R1X5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Abcc5Q9R1X5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Abcc5Q9R1X5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Abcc5Q9R1X5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Abcc5Q9R1X5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
Abcc5Q9R1X5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Abcc5Q9R1X5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Abcc5Q9R1X5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Abcc5Q9R1X5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Abcc5Q9R1X5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Abcc5Q9R1X5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Abcc5Q9R1X5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Abcc5Q9R1X5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Abcc5Q9R1X5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Abcc5Q9R1X5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Abcc5Q9R1X5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Abcc5Q9R1X5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Abcc5Q9R1X5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Abcc5Q9R1X5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Abcc5Q9R1X5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Abcc5Q9R1X5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Abcc5Q9R1X5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Abcc5Q9R1X5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Abcc5Q9R1X5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Abcc5Q9R1X5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Abcc5Q9R1X5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Abcc5Q9R1X5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Abcc5Q9R1X5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Abcc5Q9R1X5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Abcc5Q9R1X5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Abcc5Q9R1X5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Abcc5Q9R1X5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Abcc5Q9R1X5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Abcc5Q9R1X5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Abcc5Q9R1X5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Abcc5Q9R1X5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Abcc5Q9R1X5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Abcc5Q9R1X5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Abcc5Q9R1X5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
Abcc5Q9R1X5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Abcc5Q9R1X5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Abcc5Q9R1X5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Abcc5Q9R1X5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Abcc5Q9R1X5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Abcc5Q9R1X5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Abcc5Q9R1X5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Abcc5Q9R1X5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Abcc5Q9R1X5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Abcc5Q9R1X5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Abcc5Q9R1X5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Abcc5Q9R1X5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Abcc5Q9R1X5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Abcc5Q9R1X5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Abcc5Q9R1X5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Abcc5Q9R1X5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Abcc5Q9R1X5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Abcc5Q9R1X5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Abcc5Q9R1X5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Abcc5Q9R1X5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Abcc5Q9R1X5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Abcc5Q9R1X5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Abcc5Q9R1X5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Abcc5Q9R1X5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Abcc5Q9R1X5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Abcc5Q9R1X5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Abcc5Q9R1X5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Abcc5Q9R1X5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
Abcc5Q9R1X5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Abcc5Q9R1X5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Abcc5Q9R1X5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Abcc5Q9R1X5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Abcc5Q9R1X5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Abcc5Q9R1X5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Abcc5Q9R1X5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Abcc5Q9R1X5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Abcc5Q9R1X5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Abcc5Q9R1X5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Abcc5Q9R1X5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Abcc5Q9R1X5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Abcc5Q9R1X5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Abcc5Q9R1X5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Abcc5Q9R1X5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Abcc5Q9R1X5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Abcc5Q9R1X5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Abcc5Q9R1X5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Abcc5Q9R1X5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms