Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S8

Capn7, Calpain-7, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn7Q9R1S8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn7Q9R1S8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn7Q9R1S8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn7Q9R1S8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn7Q9R1S8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn7Q9R1S8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn7Q9R1S8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn7Q9R1S8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn7Q9R1S8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn7Q9R1S8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn7Q9R1S8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn7Q9R1S8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn7Q9R1S8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn7Q9R1S8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn7Q9R1S8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn7Q9R1S8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn7Q9R1S8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn7Q9R1S8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn7Q9R1S8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn7Q9R1S8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn7Q9R1S8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn7Q9R1S8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn7Q9R1S8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn7Q9R1S8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capn7Q9R1S8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capn7Q9R1S8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capn7Q9R1S8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capn7Q9R1S8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Capn7Q9R1S8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn7Q9R1S8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn7Q9R1S8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn7Q9R1S8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn7Q9R1S8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn7Q9R1S8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn7Q9R1S8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn7Q9R1S8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn7Q9R1S8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn7Q9R1S8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn7Q9R1S8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn7Q9R1S8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn7Q9R1S8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn7Q9R1S8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn7Q9R1S8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn7Q9R1S8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn7Q9R1S8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capn7Q9R1S8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capn7Q9R1S8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capn7Q9R1S8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn7Q9R1S8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn7Q9R1S8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn7Q9R1S8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn7Q9R1S8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn7Q9R1S8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn7Q9R1S8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capn7Q9R1S8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capn7Q9R1S8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Capn7Q9R1S8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Capn7Q9R1S8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Capn7Q9R1S8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Capn7Q9R1S8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn7Q9R1S8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn7Q9R1S8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn7Q9R1S8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn7Q9R1S8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn7Q9R1S8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn7Q9R1S8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn7Q9R1S8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn7Q9R1S8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn7Q9R1S8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn7Q9R1S8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn7Q9R1S8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn7Q9R1S8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn7Q9R1S8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn7Q9R1S8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn7Q9R1S8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn7Q9R1S8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn7Q9R1S8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn7Q9R1S8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn7Q9R1S8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn7Q9R1S8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn7Q9R1S8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn7Q9R1S8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn7Q9R1S8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn7Q9R1S8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn7Q9R1S8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn7Q9R1S8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn7Q9R1S8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn7Q9R1S8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn7Q9R1S8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn7Q9R1S8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn7Q9R1S8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn7Q9R1S8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn7Q9R1S8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn7Q9R1S8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn7Q9R1S8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn7Q9R1S8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn7Q9R1S8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn7Q9R1S8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn7Q9R1S8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn7Q9R1S8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms