Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0W9

Chrna6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna6Q9R0W9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna6Q9R0W9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna6Q9R0W9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna6Q9R0W9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna6Q9R0W9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna6Q9R0W9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna6Q9R0W9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna6Q9R0W9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna6Q9R0W9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna6Q9R0W9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chrna6Q9R0W9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna6Q9R0W9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna6Q9R0W9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna6Q9R0W9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna6Q9R0W9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrna6Q9R0W9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrna6Q9R0W9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrna6Q9R0W9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrna6Q9R0W9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chrna6Q9R0W9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chrna6Q9R0W9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chrna6Q9R0W9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chrna6Q9R0W9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chrna6Q9R0W9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chrna6Q9R0W9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chrna6Q9R0W9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chrna6Q9R0W9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chrna6Q9R0W9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chrna6Q9R0W9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chrna6Q9R0W9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chrna6Q9R0W9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chrna6Q9R0W9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chrna6Q9R0W9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chrna6Q9R0W9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chrna6Q9R0W9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chrna6Q9R0W9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chrna6Q9R0W9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chrna6Q9R0W9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chrna6Q9R0W9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chrna6Q9R0W9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chrna6Q9R0W9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chrna6Q9R0W9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrna6Q9R0W9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrna6Q9R0W9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrna6Q9R0W9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrna6Q9R0W9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrna6Q9R0W9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chrna6Q9R0W9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chrna6Q9R0W9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chrna6Q9R0W9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chrna6Q9R0W9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrna6Q9R0W9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrna6Q9R0W9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrna6Q9R0W9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrna6Q9R0W9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrna6Q9R0W9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrna6Q9R0W9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrna6Q9R0W9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chrna6Q9R0W9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chrna6Q9R0W9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Chrna6Q9R0W9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chrna6Q9R0W9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chrna6Q9R0W9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chrna6Q9R0W9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chrna6Q9R0W9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chrna6Q9R0W9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna6Q9R0W9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna6Q9R0W9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna6Q9R0W9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna6Q9R0W9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna6Q9R0W9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna6Q9R0W9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrna6Q9R0W9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrna6Q9R0W9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrna6Q9R0W9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrna6Q9R0W9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Chrna6Q9R0W9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Chrna6Q9R0W9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chrna6Q9R0W9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chrna6Q9R0W9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chrna6Q9R0W9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chrna6Q9R0W9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chrna6Q9R0W9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chrna6Q9R0W9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chrna6Q9R0W9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chrna6Q9R0W9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chrna6Q9R0W9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna6Q9R0W9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna6Q9R0W9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna6Q9R0W9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna6Q9R0W9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna6Q9R0W9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna6Q9R0W9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna6Q9R0W9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chrna6Q9R0W9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chrna6Q9R0W9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chrna6Q9R0W9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrna6Q9R0W9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrna6Q9R0W9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrna6Q9R0W9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms