Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpc1Q9QZF2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpc1Q9QZF2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gpc1Q9QZF2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gpc1Q9QZF2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gpc1Q9QZF2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpc1Q9QZF2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpc1Q9QZF2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpc1Q9QZF2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpc1Q9QZF2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpc1Q9QZF2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpc1Q9QZF2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpc1Q9QZF2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpc1Q9QZF2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpc1Q9QZF2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpc1Q9QZF2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpc1Q9QZF2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpc1Q9QZF2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpc1Q9QZF2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpc1Q9QZF2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpc1Q9QZF2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpc1Q9QZF2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpc1Q9QZF2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpc1Q9QZF2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpc1Q9QZF2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpc1Q9QZF2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpc1Q9QZF2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpc1Q9QZF2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpc1Q9QZF2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpc1Q9QZF2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpc1Q9QZF2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpc1Q9QZF2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpc1Q9QZF2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpc1Q9QZF2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpc1Q9QZF2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpc1Q9QZF2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpc1Q9QZF2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpc1Q9QZF2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpc1Q9QZF2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpc1Q9QZF2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpc1Q9QZF2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpc1Q9QZF2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpc1Q9QZF2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpc1Q9QZF2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpc1Q9QZF2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpc1Q9QZF2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpc1Q9QZF2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpc1Q9QZF2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpc1Q9QZF2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gpc1Q9QZF2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gpc1Q9QZF2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gpc1Q9QZF2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpc1Q9QZF2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpc1Q9QZF2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpc1Q9QZF2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpc1Q9QZF2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpc1Q9QZF2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpc1Q9QZF2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpc1Q9QZF2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpc1Q9QZF2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpc1Q9QZF2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpc1Q9QZF2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpc1Q9QZF2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpc1Q9QZF2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpc1Q9QZF2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpc1Q9QZF2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpc1Q9QZF2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpc1Q9QZF2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpc1Q9QZF2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpc1Q9QZF2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpc1Q9QZF2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpc1Q9QZF2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpc1Q9QZF2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpc1Q9QZF2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpc1Q9QZF2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpc1Q9QZF2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpc1Q9QZF2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpc1Q9QZF2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpc1Q9QZF2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpc1Q9QZF2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpc1Q9QZF2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gpc1Q9QZF2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gpc1Q9QZF2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gpc1Q9QZF2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gpc1Q9QZF2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpc1Q9QZF2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpc1Q9QZF2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpc1Q9QZF2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpc1Q9QZF2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpc1Q9QZF2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpc1Q9QZF2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gpc1Q9QZF2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gpc1Q9QZF2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gpc1Q9QZF2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gpc1Q9QZF2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gpc1Q9QZF2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gpc1Q9QZF2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpc1Q9QZF2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpc1Q9QZF2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpc1Q9QZF2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106 ms