Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpc3Q9QZC1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpc3Q9QZC1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpc3Q9QZC1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpc3Q9QZC1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpc3Q9QZC1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpc3Q9QZC1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpc3Q9QZC1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpc3Q9QZC1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpc3Q9QZC1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpc3Q9QZC1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpc3Q9QZC1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpc3Q9QZC1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpc3Q9QZC1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trpc3Q9QZC1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trpc3Q9QZC1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trpc3Q9QZC1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trpc3Q9QZC1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trpc3Q9QZC1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trpc3Q9QZC1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpc3Q9QZC1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpc3Q9QZC1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpc3Q9QZC1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpc3Q9QZC1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpc3Q9QZC1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpc3Q9QZC1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpc3Q9QZC1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpc3Q9QZC1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpc3Q9QZC1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpc3Q9QZC1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpc3Q9QZC1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpc3Q9QZC1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpc3Q9QZC1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpc3Q9QZC1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpc3Q9QZC1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpc3Q9QZC1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpc3Q9QZC1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpc3Q9QZC1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpc3Q9QZC1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpc3Q9QZC1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpc3Q9QZC1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpc3Q9QZC1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpc3Q9QZC1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpc3Q9QZC1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trpc3Q9QZC1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpc3Q9QZC1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpc3Q9QZC1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trpc3Q9QZC1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trpc3Q9QZC1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trpc3Q9QZC1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Trpc3Q9QZC1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpc3Q9QZC1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpc3Q9QZC1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpc3Q9QZC1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpc3Q9QZC1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpc3Q9QZC1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpc3Q9QZC1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpc3Q9QZC1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpc3Q9QZC1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpc3Q9QZC1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpc3Q9QZC1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpc3Q9QZC1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpc3Q9QZC1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpc3Q9QZC1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpc3Q9QZC1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpc3Q9QZC1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpc3Q9QZC1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpc3Q9QZC1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpc3Q9QZC1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpc3Q9QZC1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpc3Q9QZC1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpc3Q9QZC1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpc3Q9QZC1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpc3Q9QZC1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpc3Q9QZC1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpc3Q9QZC1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpc3Q9QZC1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpc3Q9QZC1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpc3Q9QZC1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpc3Q9QZC1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpc3Q9QZC1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpc3Q9QZC1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpc3Q9QZC1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpc3Q9QZC1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpc3Q9QZC1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpc3Q9QZC1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpc3Q9QZC1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpc3Q9QZC1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpc3Q9QZC1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpc3Q9QZC1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpc3Q9QZC1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpc3Q9QZC1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpc3Q9QZC1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpc3Q9QZC1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpc3Q9QZC1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpc3Q9QZC1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpc3Q9QZC1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpc3Q9QZC1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpc3Q9QZC1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpc3Q9QZC1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms