Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nufip1Q9QXX8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nufip1Q9QXX8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nufip1Q9QXX8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nufip1Q9QXX8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nufip1Q9QXX8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nufip1Q9QXX8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nufip1Q9QXX8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nufip1Q9QXX8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nufip1Q9QXX8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nufip1Q9QXX8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nufip1Q9QXX8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nufip1Q9QXX8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nufip1Q9QXX8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nufip1Q9QXX8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Nufip1Q9QXX8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nufip1Q9QXX8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nufip1Q9QXX8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nufip1Q9QXX8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nufip1Q9QXX8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nufip1Q9QXX8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nufip1Q9QXX8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nufip1Q9QXX8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nufip1Q9QXX8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nufip1Q9QXX8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nufip1Q9QXX8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nufip1Q9QXX8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nufip1Q9QXX8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nufip1Q9QXX8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nufip1Q9QXX8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nufip1Q9QXX8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nufip1Q9QXX8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nufip1Q9QXX8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nufip1Q9QXX8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nufip1Q9QXX8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nufip1Q9QXX8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nufip1Q9QXX8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nufip1Q9QXX8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nufip1Q9QXX8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nufip1Q9QXX8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nufip1Q9QXX8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nufip1Q9QXX8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nufip1Q9QXX8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nufip1Q9QXX8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nufip1Q9QXX8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nufip1Q9QXX8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nufip1Q9QXX8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nufip1Q9QXX8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nufip1Q9QXX8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nufip1Q9QXX8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nufip1Q9QXX8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nufip1Q9QXX8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nufip1Q9QXX8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nufip1Q9QXX8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nufip1Q9QXX8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nufip1Q9QXX8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nufip1Q9QXX8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nufip1Q9QXX8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nufip1Q9QXX8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nufip1Q9QXX8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nufip1Q9QXX8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nufip1Q9QXX8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nufip1Q9QXX8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nufip1Q9QXX8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nufip1Q9QXX8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nufip1Q9QXX8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nufip1Q9QXX8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nufip1Q9QXX8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nufip1Q9QXX8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nufip1Q9QXX8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nufip1Q9QXX8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nufip1Q9QXX8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nufip1Q9QXX8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nufip1Q9QXX8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nufip1Q9QXX8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nufip1Q9QXX8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nufip1Q9QXX8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nufip1Q9QXX8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nufip1Q9QXX8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nufip1Q9QXX8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nufip1Q9QXX8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nufip1Q9QXX8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nufip1Q9QXX8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nufip1Q9QXX8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nufip1Q9QXX8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nufip1Q9QXX8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nufip1Q9QXX8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nufip1Q9QXX8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nufip1Q9QXX8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nufip1Q9QXX8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nufip1Q9QXX8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nufip1Q9QXX8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nufip1Q9QXX8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nufip1Q9QXX8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nufip1Q9QXX8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nufip1Q9QXX8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nufip1Q9QXX8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nufip1Q9QXX8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nufip1Q9QXX8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nufip1Q9QXX8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms