Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsm4Q9QXA5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsm4Q9QXA5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsm4Q9QXA5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsm4Q9QXA5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsm4Q9QXA5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsm4Q9QXA5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsm4Q9QXA5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsm4Q9QXA5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsm4Q9QXA5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsm4Q9QXA5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsm4Q9QXA5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsm4Q9QXA5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsm4Q9QXA5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsm4Q9QXA5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsm4Q9QXA5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsm4Q9QXA5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsm4Q9QXA5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsm4Q9QXA5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsm4Q9QXA5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsm4Q9QXA5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsm4Q9QXA5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lsm4Q9QXA5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lsm4Q9QXA5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lsm4Q9QXA5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lsm4Q9QXA5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsm4Q9QXA5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsm4Q9QXA5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsm4Q9QXA5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsm4Q9QXA5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsm4Q9QXA5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lsm4Q9QXA5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lsm4Q9QXA5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lsm4Q9QXA5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lsm4Q9QXA5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsm4Q9QXA5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsm4Q9QXA5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsm4Q9QXA5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsm4Q9QXA5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsm4Q9QXA5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsm4Q9QXA5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsm4Q9QXA5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsm4Q9QXA5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsm4Q9QXA5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm4Q9QXA5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm4Q9QXA5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm4Q9QXA5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm4Q9QXA5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm4Q9QXA5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm4Q9QXA5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsm4Q9QXA5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsm4Q9QXA5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsm4Q9QXA5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsm4Q9QXA5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsm4Q9QXA5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lsm4Q9QXA5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsm4Q9QXA5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsm4Q9QXA5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm4Q9QXA5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm4Q9QXA5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm4Q9QXA5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm4Q9QXA5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm4Q9QXA5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm4Q9QXA5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm4Q9QXA5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm4Q9QXA5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm4Q9QXA5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm4Q9QXA5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm4Q9QXA5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm4Q9QXA5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm4Q9QXA5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm4Q9QXA5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm4Q9QXA5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm4Q9QXA5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm4Q9QXA5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm4Q9QXA5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lsm4Q9QXA5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lsm4Q9QXA5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lsm4Q9QXA5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lsm4Q9QXA5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lsm4Q9QXA5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lsm4Q9QXA5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lsm4Q9QXA5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lsm4Q9QXA5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lsm4Q9QXA5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lsm4Q9QXA5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lsm4Q9QXA5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lsm4Q9QXA5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lsm4Q9QXA5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lsm4Q9QXA5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lsm4Q9QXA5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lsm4Q9QXA5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lsm4Q9QXA5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lsm4Q9QXA5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lsm4Q9QXA5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lsm4Q9QXA5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lsm4Q9QXA5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lsm4Q9QXA5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lsm4Q9QXA5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lsm4Q9QXA5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms