Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rabgef1Q9JM13 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rabgef1Q9JM13 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rabgef1Q9JM13 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rabgef1Q9JM13 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rabgef1Q9JM13 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rabgef1Q9JM13 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rabgef1Q9JM13 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rabgef1Q9JM13 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rabgef1Q9JM13 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rabgef1Q9JM13 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rabgef1Q9JM13 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rabgef1Q9JM13 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rabgef1Q9JM13 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rabgef1Q9JM13 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rabgef1Q9JM13 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rabgef1Q9JM13 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rabgef1Q9JM13 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rabgef1Q9JM13 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rabgef1Q9JM13 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rabgef1Q9JM13 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rabgef1Q9JM13 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rabgef1Q9JM13 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rabgef1Q9JM13 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rabgef1Q9JM13 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rabgef1Q9JM13 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rabgef1Q9JM13 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rabgef1Q9JM13 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rabgef1Q9JM13 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rabgef1Q9JM13 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rabgef1Q9JM13 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rabgef1Q9JM13 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rabgef1Q9JM13 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rabgef1Q9JM13 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rabgef1Q9JM13 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rabgef1Q9JM13 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rabgef1Q9JM13 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rabgef1Q9JM13 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rabgef1Q9JM13 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rabgef1Q9JM13 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rabgef1Q9JM13 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rabgef1Q9JM13 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rabgef1Q9JM13 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rabgef1Q9JM13 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rabgef1Q9JM13 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rabgef1Q9JM13 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rabgef1Q9JM13 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rabgef1Q9JM13 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rabgef1Q9JM13 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rabgef1Q9JM13 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rabgef1Q9JM13 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rabgef1Q9JM13 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rabgef1Q9JM13 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rabgef1Q9JM13 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rabgef1Q9JM13 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rabgef1Q9JM13 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rabgef1Q9JM13 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rabgef1Q9JM13 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rabgef1Q9JM13 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rabgef1Q9JM13 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rabgef1Q9JM13 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rabgef1Q9JM13 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rabgef1Q9JM13 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rabgef1Q9JM13 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rabgef1Q9JM13 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rabgef1Q9JM13 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rabgef1Q9JM13 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rabgef1Q9JM13 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rabgef1Q9JM13 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rabgef1Q9JM13 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rabgef1Q9JM13 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rabgef1Q9JM13 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rabgef1Q9JM13 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rabgef1Q9JM13 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rabgef1Q9JM13 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rabgef1Q9JM13 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rabgef1Q9JM13 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rabgef1Q9JM13 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rabgef1Q9JM13 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rabgef1Q9JM13 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rabgef1Q9JM13 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rabgef1Q9JM13 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rabgef1Q9JM13 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rabgef1Q9JM13 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rabgef1Q9JM13 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rabgef1Q9JM13 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rabgef1Q9JM13 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rabgef1Q9JM13 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rabgef1Q9JM13 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rabgef1Q9JM13 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rabgef1Q9JM13 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rabgef1Q9JM13 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rabgef1Q9JM13 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms