Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf19Q9JLL3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf19Q9JLL3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf19Q9JLL3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf19Q9JLL3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf19Q9JLL3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf19Q9JLL3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfrsf19Q9JLL3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfrsf19Q9JLL3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfrsf19Q9JLL3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfrsf19Q9JLL3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfrsf19Q9JLL3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf19Q9JLL3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf19Q9JLL3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf19Q9JLL3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfrsf19Q9JLL3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfrsf19Q9JLL3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnfrsf19Q9JLL3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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