Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpa33Q9JKA5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpa33Q9JKA5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpa33Q9JKA5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpa33Q9JKA5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpa33Q9JKA5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpa33Q9JKA5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpa33Q9JKA5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpa33Q9JKA5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpa33Q9JKA5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpa33Q9JKA5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpa33Q9JKA5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpa33Q9JKA5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpa33Q9JKA5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpa33Q9JKA5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpa33Q9JKA5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpa33Q9JKA5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpa33Q9JKA5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpa33Q9JKA5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpa33Q9JKA5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpa33Q9JKA5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpa33Q9JKA5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpa33Q9JKA5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpa33Q9JKA5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpa33Q9JKA5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpa33Q9JKA5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpa33Q9JKA5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpa33Q9JKA5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpa33Q9JKA5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpa33Q9JKA5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpa33Q9JKA5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpa33Q9JKA5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpa33Q9JKA5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpa33Q9JKA5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpa33Q9JKA5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpa33Q9JKA5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpa33Q9JKA5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpa33Q9JKA5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpa33Q9JKA5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpa33Q9JKA5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpa33Q9JKA5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpa33Q9JKA5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpa33Q9JKA5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpa33Q9JKA5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpa33Q9JKA5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpa33Q9JKA5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpa33Q9JKA5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpa33Q9JKA5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpa33Q9JKA5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpa33Q9JKA5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpa33Q9JKA5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpa33Q9JKA5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpa33Q9JKA5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpa33Q9JKA5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpa33Q9JKA5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpa33Q9JKA5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpa33Q9JKA5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpa33Q9JKA5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpa33Q9JKA5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpa33Q9JKA5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpa33Q9JKA5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpa33Q9JKA5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpa33Q9JKA5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpa33Q9JKA5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpa33Q9JKA5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpa33Q9JKA5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpa33Q9JKA5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpa33Q9JKA5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpa33Q9JKA5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpa33Q9JKA5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpa33Q9JKA5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpa33Q9JKA5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpa33Q9JKA5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpa33Q9JKA5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpa33Q9JKA5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpa33Q9JKA5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpa33Q9JKA5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpa33Q9JKA5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpa33Q9JKA5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpa33Q9JKA5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpa33Q9JKA5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpa33Q9JKA5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpa33Q9JKA5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpa33Q9JKA5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpa33Q9JKA5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpa33Q9JKA5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpa33Q9JKA5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpa33Q9JKA5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpa33Q9JKA5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpa33Q9JKA5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpa33Q9JKA5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpa33Q9JKA5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpa33Q9JKA5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpa33Q9JKA5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpa33Q9JKA5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpa33Q9JKA5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpa33Q9JKA5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpa33Q9JKA5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpa33Q9JKA5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpa33Q9JKA5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms