Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Riox1Q9JJF3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Riox1Q9JJF3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Riox1Q9JJF3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Riox1Q9JJF3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Riox1Q9JJF3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Riox1Q9JJF3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Riox1Q9JJF3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Riox1Q9JJF3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Riox1Q9JJF3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Riox1Q9JJF3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Riox1Q9JJF3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Riox1Q9JJF3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Riox1Q9JJF3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Riox1Q9JJF3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Riox1Q9JJF3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Riox1Q9JJF3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Riox1Q9JJF3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Riox1Q9JJF3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Riox1Q9JJF3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Riox1Q9JJF3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Riox1Q9JJF3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Riox1Q9JJF3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Riox1Q9JJF3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Riox1Q9JJF3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Riox1Q9JJF3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Riox1Q9JJF3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Riox1Q9JJF3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Riox1Q9JJF3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Riox1Q9JJF3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Riox1Q9JJF3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Riox1Q9JJF3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Riox1Q9JJF3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Riox1Q9JJF3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Riox1Q9JJF3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Riox1Q9JJF3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Riox1Q9JJF3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Riox1Q9JJF3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Riox1Q9JJF3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Riox1Q9JJF3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Riox1Q9JJF3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Riox1Q9JJF3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Riox1Q9JJF3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Riox1Q9JJF3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Riox1Q9JJF3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Riox1Q9JJF3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Riox1Q9JJF3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Riox1Q9JJF3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Riox1Q9JJF3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Riox1Q9JJF3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Riox1Q9JJF3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Riox1Q9JJF3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Riox1Q9JJF3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Riox1Q9JJF3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Riox1Q9JJF3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Riox1Q9JJF3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Riox1Q9JJF3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Riox1Q9JJF3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Riox1Q9JJF3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Riox1Q9JJF3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Riox1Q9JJF3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Riox1Q9JJF3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Riox1Q9JJF3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Riox1Q9JJF3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Riox1Q9JJF3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Riox1Q9JJF3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Riox1Q9JJF3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Riox1Q9JJF3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Riox1Q9JJF3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Riox1Q9JJF3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Riox1Q9JJF3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Riox1Q9JJF3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Riox1Q9JJF3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Riox1Q9JJF3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Riox1Q9JJF3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Riox1Q9JJF3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Riox1Q9JJF3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Riox1Q9JJF3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Riox1Q9JJF3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Riox1Q9JJF3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Riox1Q9JJF3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Riox1Q9JJF3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Riox1Q9JJF3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Riox1Q9JJF3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Riox1Q9JJF3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Riox1Q9JJF3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Riox1Q9JJF3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Riox1Q9JJF3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Riox1Q9JJF3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Riox1Q9JJF3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Riox1Q9JJF3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Riox1Q9JJF3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Riox1Q9JJF3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Riox1Q9JJF3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Riox1Q9JJF3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Riox1Q9JJF3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Riox1Q9JJF3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Riox1Q9JJF3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Riox1Q9JJF3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Riox1Q9JJF3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms