Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pus3Q9JI38 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pus3Q9JI38 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pus3Q9JI38 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pus3Q9JI38 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pus3Q9JI38 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pus3Q9JI38 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Pus3Q9JI38 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pus3Q9JI38 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pus3Q9JI38 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pus3Q9JI38 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pus3Q9JI38 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pus3Q9JI38 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Pus3Q9JI38 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pus3Q9JI38 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pus3Q9JI38 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pus3Q9JI38 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pus3Q9JI38 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pus3Q9JI38 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pus3Q9JI38 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pus3Q9JI38 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pus3Q9JI38 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Pus3Q9JI38 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Pus3Q9JI38 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pus3Q9JI38 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pus3Q9JI38 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pus3Q9JI38 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pus3Q9JI38 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pus3Q9JI38 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pus3Q9JI38 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pus3Q9JI38 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pus3Q9JI38 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pus3Q9JI38 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pus3Q9JI38 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pus3Q9JI38 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pus3Q9JI38 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Pus3Q9JI38 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pus3Q9JI38 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Pus3Q9JI38 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pus3Q9JI38 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pus3Q9JI38 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pus3Q9JI38 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Pus3Q9JI38 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pus3Q9JI38 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pus3Q9JI38 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pus3Q9JI38 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pus3Q9JI38 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pus3Q9JI38 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Pus3Q9JI38 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pus3Q9JI38 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pus3Q9JI38 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pus3Q9JI38 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pus3Q9JI38 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Pus3Q9JI38 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pus3Q9JI38 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pus3Q9JI38 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pus3Q9JI38 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pus3Q9JI38 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pus3Q9JI38 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pus3Q9JI38 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pus3Q9JI38 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pus3Q9JI38 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pus3Q9JI38 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pus3Q9JI38 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pus3Q9JI38 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pus3Q9JI38 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pus3Q9JI38 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pus3Q9JI38 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pus3Q9JI38 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pus3Q9JI38 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pus3Q9JI38 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pus3Q9JI38 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pus3Q9JI38 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pus3Q9JI38 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pus3Q9JI38 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pus3Q9JI38 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pus3Q9JI38 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pus3Q9JI38 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Pus3Q9JI38 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pus3Q9JI38 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pus3Q9JI38 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pus3Q9JI38 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pus3Q9JI38 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pus3Q9JI38 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pus3Q9JI38 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pus3Q9JI38 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pus3Q9JI38 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pus3Q9JI38 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pus3Q9JI38 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pus3Q9JI38 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pus3Q9JI38 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pus3Q9JI38 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pus3Q9JI38 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pus3Q9JI38 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pus3Q9JI38 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Pus3Q9JI38 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Pus3Q9JI38 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Pus3Q9JI38 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pus3Q9JI38 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pus3Q9JI38 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 197.4 ms