Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESJ0

Xpo4, Exportin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xpo4Q9ESJ0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Xpo4Q9ESJ0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Xpo4Q9ESJ0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Xpo4Q9ESJ0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Xpo4Q9ESJ0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Xpo4Q9ESJ0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Xpo4Q9ESJ0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Xpo4Q9ESJ0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Xpo4Q9ESJ0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Xpo4Q9ESJ0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Xpo4Q9ESJ0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Xpo4Q9ESJ0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Xpo4Q9ESJ0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Xpo4Q9ESJ0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Xpo4Q9ESJ0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Xpo4Q9ESJ0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Xpo4Q9ESJ0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Xpo4Q9ESJ0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Xpo4Q9ESJ0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Xpo4Q9ESJ0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Xpo4Q9ESJ0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Xpo4Q9ESJ0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Xpo4Q9ESJ0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Xpo4Q9ESJ0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Xpo4Q9ESJ0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Xpo4Q9ESJ0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Xpo4Q9ESJ0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Xpo4Q9ESJ0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Xpo4Q9ESJ0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Xpo4Q9ESJ0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Xpo4Q9ESJ0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Xpo4Q9ESJ0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Xpo4Q9ESJ0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Xpo4Q9ESJ0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Xpo4Q9ESJ0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Xpo4Q9ESJ0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Xpo4Q9ESJ0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Xpo4Q9ESJ0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Xpo4Q9ESJ0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Xpo4Q9ESJ0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Xpo4Q9ESJ0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Xpo4Q9ESJ0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Xpo4Q9ESJ0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Xpo4Q9ESJ0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Xpo4Q9ESJ0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Xpo4Q9ESJ0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Xpo4Q9ESJ0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Xpo4Q9ESJ0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Xpo4Q9ESJ0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Xpo4Q9ESJ0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Xpo4Q9ESJ0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Xpo4Q9ESJ0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Xpo4Q9ESJ0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Xpo4Q9ESJ0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Xpo4Q9ESJ0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Xpo4Q9ESJ0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Xpo4Q9ESJ0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Xpo4Q9ESJ0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Xpo4Q9ESJ0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Xpo4Q9ESJ0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Xpo4Q9ESJ0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Xpo4Q9ESJ0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Xpo4Q9ESJ0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Xpo4Q9ESJ0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Xpo4Q9ESJ0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Xpo4Q9ESJ0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Xpo4Q9ESJ0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Xpo4Q9ESJ0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Xpo4Q9ESJ0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Xpo4Q9ESJ0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Xpo4Q9ESJ0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Xpo4Q9ESJ0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Xpo4Q9ESJ0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Xpo4Q9ESJ0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Xpo4Q9ESJ0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Xpo4Q9ESJ0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Xpo4Q9ESJ0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Xpo4Q9ESJ0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Xpo4Q9ESJ0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Xpo4Q9ESJ0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Xpo4Q9ESJ0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Xpo4Q9ESJ0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Xpo4Q9ESJ0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Xpo4Q9ESJ0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Xpo4Q9ESJ0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Xpo4Q9ESJ0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Xpo4Q9ESJ0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Xpo4Q9ESJ0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Xpo4Q9ESJ0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Xpo4Q9ESJ0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Xpo4Q9ESJ0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Xpo4Q9ESJ0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Xpo4Q9ESJ0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Xpo4Q9ESJ0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Xpo4Q9ESJ0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Xpo4Q9ESJ0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Xpo4Q9ESJ0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Xpo4Q9ESJ0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Xpo4Q9ESJ0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Xpo4Q9ESJ0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms