Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR4

Apbb2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb2Q9DBR4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apbb2Q9DBR4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apbb2Q9DBR4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apbb2Q9DBR4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apbb2Q9DBR4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apbb2Q9DBR4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apbb2Q9DBR4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apbb2Q9DBR4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apbb2Q9DBR4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apbb2Q9DBR4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apbb2Q9DBR4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apbb2Q9DBR4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apbb2Q9DBR4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apbb2Q9DBR4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apbb2Q9DBR4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apbb2Q9DBR4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apbb2Q9DBR4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apbb2Q9DBR4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apbb2Q9DBR4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apbb2Q9DBR4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apbb2Q9DBR4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apbb2Q9DBR4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apbb2Q9DBR4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apbb2Q9DBR4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apbb2Q9DBR4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apbb2Q9DBR4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apbb2Q9DBR4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apbb2Q9DBR4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apbb2Q9DBR4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apbb2Q9DBR4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apbb2Q9DBR4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apbb2Q9DBR4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apbb2Q9DBR4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apbb2Q9DBR4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apbb2Q9DBR4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apbb2Q9DBR4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apbb2Q9DBR4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apbb2Q9DBR4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apbb2Q9DBR4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apbb2Q9DBR4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apbb2Q9DBR4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apbb2Q9DBR4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apbb2Q9DBR4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apbb2Q9DBR4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apbb2Q9DBR4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apbb2Q9DBR4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apbb2Q9DBR4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Apbb2Q9DBR4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apbb2Q9DBR4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apbb2Q9DBR4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apbb2Q9DBR4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Apbb2Q9DBR4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apbb2Q9DBR4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apbb2Q9DBR4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apbb2Q9DBR4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apbb2Q9DBR4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Apbb2Q9DBR4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apbb2Q9DBR4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apbb2Q9DBR4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apbb2Q9DBR4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apbb2Q9DBR4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apbb2Q9DBR4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apbb2Q9DBR4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apbb2Q9DBR4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apbb2Q9DBR4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apbb2Q9DBR4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apbb2Q9DBR4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Apbb2Q9DBR4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Apbb2Q9DBR4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apbb2Q9DBR4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apbb2Q9DBR4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apbb2Q9DBR4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apbb2Q9DBR4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apbb2Q9DBR4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Apbb2Q9DBR4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apbb2Q9DBR4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apbb2Q9DBR4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apbb2Q9DBR4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apbb2Q9DBR4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Apbb2Q9DBR4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apbb2Q9DBR4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apbb2Q9DBR4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apbb2Q9DBR4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apbb2Q9DBR4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apbb2Q9DBR4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apbb2Q9DBR4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apbb2Q9DBR4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apbb2Q9DBR4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apbb2Q9DBR4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apbb2Q9DBR4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apbb2Q9DBR4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apbb2Q9DBR4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apbb2Q9DBR4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apbb2Q9DBR4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apbb2Q9DBR4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apbb2Q9DBR4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apbb2Q9DBR4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apbb2Q9DBR4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apbb2Q9DBR4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apbb2Q9DBR4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms